RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCTP1Q6DN14 999 aa18.9■□□□□ 0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GAS2L3Q86XJ1 694 aa18.9■□□□□ 0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTG4Q9NY30 223 aa18.9■□□□□ 0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PALD1Q9ULE6 856 aa18.9■□□□□ 0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRPEL1Q9HAV7 217 aa18.9■□□□□ 0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.89■□□□□ 0.62
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL18A1P39060 1754 aa18.89■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FSD2A1L4K1 749 aa18.89■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RABEP1Q15276 862 aa18.89■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.89■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCAF5Q96JK2 942 aa18.89■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.89■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa18.89■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARID3AQ99856 593 aa18.89■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.89■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C5P01031 1676 aa18.89■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HYPKQ9NX55 129 aa18.88■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCAPD2Q15021 1401 aa18.88■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRM8O00222 908 aa18.88■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAMTS2O95450 1211 aa18.88■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXB7P09629 217 aa18.88■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLCN1P35523 988 aa18.88■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SALL3Q9BXA9 1300 aa18.88■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPRNQ4KMQ1 711 aa18.87■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR17Q8IZU2 1322 aa18.87■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDE4CQ08493 712 aa18.87■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLA2Q14181 598 aa18.87■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NBPF26B4DH59 902 aa18.86■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NBPF14Q5TI25 921 aa18.86■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa18.86■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NBPF15Q8N660 670 aa18.86■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.86■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA6L22H0YM25 854 aa18.86■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.86■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERC2O15083 957 aa18.85■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHGBP05060 677 aa18.85■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRE11P49959 708 aa18.85■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEK4P51957 841 aa18.85■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AACSQ86V21 672 aa18.85■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ST18O60284 1047 aa18.84■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 REC8O95072 547 aa18.84■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHMLP26374 656 aa18.84■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINS1Q8NG48 757 aa18.84■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCCP43146 1447 aa18.84■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEURL1BA8MQ27 555 aa18.84■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL2RBP14784 551 aa18.84■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.84■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.83■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCN11AQ9UI33 1791 aa18.83■□□□□ 0.61
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PI4K2BQ8TCG2 481 aa18.83■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.83■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPA1P15085 419 aa18.82■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIP4K2BP78356 416 aa18.82■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEXNQ0ZGT2 675 aa18.82■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SASH1O94885 1247 aa18.82■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GCKRQ14397 625 aa18.82■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A087WZG4 1122 aa18.81■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa18.81■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.81■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.81■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BOLA2Q9H3K6 86 aa18.81■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRDM4Q9UKN5 801 aa18.81■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.79■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYNE4Q8N205 404 aa18.79■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALDH1L1O75891 902 aa18.78■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPDO75976 1380 aa18.78■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa18.78■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.78■□□□□ 0.6
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms