RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 NPHP1O15259 732 aa29.73■■■□□ 2.35
POLR2F-211ENST00000488684 ST5P78524 1137 aa29.73■■■□□ 2.35
POLR2F-211ENST00000488684 GLTPD2A6NH11 291 aa29.72■■■□□ 2.35
POLR2F-211ENST00000488684 SRGNP10124 158 aa29.72■■■□□ 2.35
POLR2F-211ENST00000488684 SLX4Q8IY92 1834 aa29.71■■■□□ 2.35
POLR2F-211ENST00000488684 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
POLR2F-211ENST00000488684 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa29.7■■■□□ 2.35
POLR2F-211ENST00000488684 NEFMP07197 916 aa29.7■■■□□ 2.35
POLR2F-211ENST00000488684 FSTL1Q12841 308 aa29.7■■■□□ 2.35
POLR2F-211ENST00000488684 NFE2L2Q16236 605 aa29.7■■■□□ 2.35
POLR2F-211ENST00000488684 STYK1Q6J9G0 422 aa29.7■■■□□ 2.35
POLR2F-211ENST00000488684 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF652Q9Y2D9 606 aa29.7■■■□□ 2.35
POLR2F-211ENST00000488684 CNKSR1Q969H4 720 aa29.69■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 TIAM2Q8IVF5 1701 aa29.68■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 HLFQ16534 295 aa29.68■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 MASTLQ96GX5 879 aa29.68■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 KDM3BQ7LBC6 1761 aa29.67■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 RGL2O15211 777 aa29.67■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 CACNA1SQ13698 1873 aa29.66■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 HTRA3P83110 453 aa29.66■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 WDR90Q96KV7 1748 aa29.65■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 LAMB4A4D0S4 1761 aa29.64■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.64■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 LTBP3Q9NS15 1303 aa29.64■■■□□ 2.34
POLR2F-211ENST00000488684 FAM177BA6PVY3 158 aa29.63■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 POTECB2RU33 542 aa29.63■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 ERFEQ4G0M1 354 aa29.63■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 NGEFQ8N5V2 710 aa29.63■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 C7orf43Q8WVR3 580 aa29.63■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 TAOK3Q9H2K8 898 aa29.63■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa29.62■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 SMC1BQ8NDV3 1235 aa29.62■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 NPR1P16066 1061 aa29.6■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 DPY19L2Q6NUT2 758 aa29.6■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.6■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.59■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 SOGA3Q5TF21 947 aa29.58■■■□□ 2.33
POLR2F-211ENST00000488684 ERVV-1B6SEH8 477 aa29.57■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 RALBP1Q15311 655 aa29.57■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 IFFO2Q5TF58 517 aa29.57■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 MYL6BP14649 208 aa29.56■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 NUP98P52948 1817 aa29.56■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 PCNTO95613 3336 aa29.55■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.55■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 OLFM4Q6UX06 510 aa29.55■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 KLRG1Q96E93 195 aa29.55■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 RIPK4P57078 832 aa29.54■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC93Q567U6 631 aa29.53■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 DDNO94850 711 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.52■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.52■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.52■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 ABCC12Q96J65 1359 aa29.52■■■□□ 2.32
POLR2F-211ENST00000488684 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29.51■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 GPTP24298 496 aa29.5■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 NYXQ9GZU5 481 aa29.5■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.49■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 ALDH1B1P30837 517 aa29.49■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP29.49■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 CRY2Q49AN0 593 aa29.49■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 PDIA6Q15084 440 aa29.48■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.48■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 JMYQ8N9B5 988 aa29.48■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 ERBB4Q15303 1308 aa29.47■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 SUSD4Q5VX71 490 aa29.47■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.47■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 RTKN2Q8IZC4 609 aa29.46■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 POTEIP0CG38 1075 aa29.45■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 POTEJP0CG39 1038 aa29.45■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
POLR2F-211ENST00000488684 PROSER3Q2NL68 480 aa29.44■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.44■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.44■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 ANXA1P04083 346 aa29.43■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 NTSR2O95665 410 aa29.42■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 SYNE4Q8N205 404 aa29.42■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 SNED1Q8TER0 1413 aa29.42■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.41■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 NEUROD2Q15784 382 aa29.41■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF541Q9H0D2 1346 aa29.41■■■□□ 2.3
POLR2F-211ENST00000488684 RIC1Q4ADV7 1423 aa29.4■■■□□ 2.3
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