RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486268.5

ERGIC3-215, Transcript of ERGIC and golgi 3, humanhuman

TSL 2

Gene ERGIC3, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3-215ENST00000486268 ALDH1L1O75891 902 aa14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 CEP85Q6P2H3 762 aa14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 DCTPP1Q9H773 170 aa14.74□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.73□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 SIK1P57059 783 aa14.73□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.73□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.73□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.73□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.72□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 ITPK1Q13572 414 aa14.72□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 PDIA6Q15084 440 aa14.72□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 BEND3Q5T5X7 828 aa14.72□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.72□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.72□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 C4BP0C0L5 1744 aa14.72□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 ADCY9O60503 1353 aa14.72□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.71□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.71□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ERGIC3-215ENST00000486268 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.7□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 ATP8B2P98198 1209 aa14.7□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 SKAP1Q86WV1 359 aa14.7□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.7□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 USP44Q9H0E7 712 aa14.7□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.69□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.69□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 ATP6V1AP38606 617 aa14.69□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 C8orf34Q49A92 452 aa14.69□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 LINS1Q8NG48 757 aa14.69□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.69□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.68□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 ZNF827Q17R98 1081 aa14.68□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 PROSER3Q2NL68 480 aa14.68□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.68□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.68□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 USP16Q9Y5T5 823 aa14.68□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 ANXA1P04083 346 aa14.67□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.67□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.67□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 UTYO14607 1347 aa14.66□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.66□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.66□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 AKT1S1Q96B36 256 aa14.66□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 COPS6Q7L5N1 327 aa14.65□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.65□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 SSH3Q8TE77 659 aa14.65□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 LNPKQ9C0E8 428 aa14.65□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 CASZ1Q86V15 1759 aa14.65□□□□□ -0.06
ERGIC3-215ENST00000486268 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 MTX1Q13505 466 aa14.64□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.64□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 C4AP0C0L4 1744 aa14.63□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 RAB11FIP3O75154 756 aa14.63□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 STARD3NLO95772 234 aa14.63□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 MYL6BP14649 208 aa14.63□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 POLA2Q14181 598 aa14.63□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 SLC15A2Q16348 729 aa14.63□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.63□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.63□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.63□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 LRP5O75197 1615 aa14.63□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 COL15A1P39059 1388 aa14.62□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 GRM8O00222 908 aa14.62□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 SMIM5Q71RC9 77 aa14.62□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 NBPF14Q5TI25 921 aa14.61□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 STK32BQ9NY57 414 aa14.61□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.61□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.6□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 NBPF26B4DH59 902 aa14.6□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 NBPF15Q8N660 670 aa14.6□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.6□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.6□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.59□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 GNPATO15228 680 aa14.59□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 A1BGP04217 495 aa14.59□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 IGKV5-2P06315 115 aa14.59□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 GCKRQ14397 625 aa14.59□□□□□ -0.07
ERGIC3-215ENST00000486268 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms