RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486223.1

FREM1-208, Transcript of FRAS1 related extracellular matrix 1, human

TSL 3

Gene FREM1, Length 815 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FREM1-208	ENST00000486223	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FREM1-208	ENST00000486223	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FREM1-208	ENST00000486223	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
FREM1-208	ENST00000486223	GNB5	O14775	395 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	AMPD1	P23109	780 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	MARK1	Q9P0L2	795 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	ATP9B	O43861	1147 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	PSME1	Q06323	249 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	SFI1	A8K8P3	1242 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	FURIN	P09958	794 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	LAMC2	Q13753	1193 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	SYT9	Q86SS6	491 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	OGFOD1	Q8N543	542 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	SERTM1	A2A2V5	107 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	XP32	Q5T750	250 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	SIX5	Q8N196	739 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223		M0R2N6	131 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	FLII	Q13045	1269 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	TRIM50	Q86XT4	487 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	ELOA3	Q8NG57	546 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	PLVAP	Q9BX97	442 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FREM1-208	ENST00000486223		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	SIN3B	O75182	1162 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	RAD21	O60216	631 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	LGR5	O75473	907 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	KCNQ4	P56696	695 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	TYRO3	Q06418	890 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	TNFRSF25	Q93038	417 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	SUSD3	Q96L08	255 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	BCS1L	Q9Y276	419 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	ALB	P02768	609 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	ILDR2	Q71H61	639 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	GLMN	Q92990	594 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	ATP1A2	P50993	1020 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	SPEM2	Q0P670	501 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	BRD7	Q9NPI1	651 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	NID1	P14543	1247 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	PTK7	Q13308	1070 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	FAM229A	H3BQW9	127 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223		M0R082	166 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	DOC2B	Q14184	412 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	WWC1	Q8IX03	1113 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	CEP63	Q96MT8	703 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FREM1-208	ENST00000486223	RASA1	P20936	1047 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FREM1-208	ENST00000486223	ARX	Q96QS3	562 aa		7.21	□□□□□ -1.26
FREM1-208	ENST00000486223	ADH7	P40394	386 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FREM1-208	ENST00000486223	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FREM1-208	ENST00000486223	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FREM1-208	ENST00000486223	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		7.2	□□□□□ -1.26
FREM1-208	ENST00000486223	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		7.19	□□□□□ -1.26
FREM1-208	ENST00000486223	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
FREM1-208	ENST00000486223	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26

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