RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484396.1

ACSS1-204, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACSS1, Length 4,767 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-204ENST00000484396 H3BQV1 296 aa14.76□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 EXOC5O00471 708 aa14.76□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 POLD1P28340 1107 aa14.76□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 TUBB4BP68371 445 aa14.76□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 IFFO2Q5TF58 517 aa14.76□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.76□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 BTBD11A6QL63 1104 aa14.76□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.76□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 INPP5BP32019 993 aa14.76□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 SH3GL3Q99963 347 aa14.76□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.75□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 GSDMDP57764 484 aa14.75□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.75□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 SCLT1Q96NL6 688 aa14.75□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.75□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 MARCH6O60337 910 aa14.75□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 STARD3NLO95772 234 aa14.75□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.75□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 VPS53Q5VIR6 699 aa14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 SLC4A2P04920 1241 aa14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 MYL6BP14649 208 aa14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 CEP170Q5SW79 1584 aa14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 TERF2Q15554 542 aa14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 VPS18Q9P253 973 aa14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 MYO1CO00159 1063 aa14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 ERC2O15083 957 aa14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 ACEP12821 1306 aa14.74□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 TUBBP07437 444 aa14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 SPATA24Q86W54 205 aa14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 TNMDQ9H2S6 317 aa14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 SYCP1Q15431 976 aa14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 ERBB4Q15303 1308 aa14.73□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 A6NNZ2 444 aa14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 CBFA2T2O43439 604 aa14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 BCAR3O75815 825 aa14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 PSMD2Q13200 908 aa14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 CCDC27Q2M243 656 aa14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.72□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 ARHGAP25P42331 645 aa14.71□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 CCDC38Q502W7 563 aa14.71□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 SMARCE1Q969G3 411 aa14.71□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.71□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.71□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.71□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 CHRNA2Q15822 529 aa14.71□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 NFE2L2Q16236 605 aa14.71□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACSS1-204ENST00000484396 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
ACSS1-204ENST00000484396 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
ACSS1-204ENST00000484396 CCDC181Q5TID7 509 aa14.71□□□□□ -0.06
ACSS1-204ENST00000484396 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.71□□□□□ -0.06
ACSS1-204ENST00000484396 PDILTQ8N807 584 aa14.71□□□□□ -0.06
ACSS1-204ENST00000484396 DISP1Q96F81 1524 aa14.71□□□□□ -0.06
ACSS1-204ENST00000484396 FAM210AQ96ND0 272 aa14.71□□□□□ -0.06
ACSS1-204ENST00000484396 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
ACSS1-204ENST00000484396 MAP3K11Q16584 847 aa14.7□□□□□ -0.06
ACSS1-204ENST00000484396 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.7□□□□□ -0.06
ACSS1-204ENST00000484396 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.7□□□□□ -0.06
ACSS1-204ENST00000484396 FIBPO43427 364 aa14.7□□□□□ -0.06
ACSS1-204ENST00000484396 MAGEA9P43362 315 aa14.7□□□□□ -0.06
ACSS1-204ENST00000484396 MCM6Q14566 821 aa14.7□□□□□ -0.06
ACSS1-204ENST00000484396 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms