RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470815.1

HERC3-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-208ENST00000470815 TXLNAP40222 546 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-208ENST00000470815 DOC2BQ14184 412 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-208ENST00000470815 SYT9Q86SS6 491 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-208ENST00000470815 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-208ENST00000470815 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-208ENST00000470815 EPHA4P54764 986 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC3-208ENST00000470815 GTF2IP78347 998 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC3-208ENST00000470815 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC3-208ENST00000470815 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC3-208ENST00000470815 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC3-208ENST00000470815 ZNF358Q9NW07 568 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC3-208ENST00000470815 PIK3CDO00329 1044 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 TNFRSF25Q93038 417 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 POM121CA8CG34 1229 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 SKIP12755 728 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 NOS2P35228 1153 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 C14orf37Q86TY3 774 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 APBA3O96018 575 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 PSME1Q06323 249 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 M0R082 166 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 NCOA4Q13772 614 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 NACC1Q96RE7 527 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 SERTM1A2A2V5 107 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 NEUROD1Q13562 356 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 POTEAQ6S8J7 498 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 USP17L5A8MUK1 530 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 KCNQ4P56696 695 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 SPEM2Q0P670 501 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 TRIM50Q86XT4 487 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 GLMNQ92990 594 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 SLC30A3Q99726 388 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-208ENST00000470815 DYRK3O43781 588 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 ALBP02768 609 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 NID1P14543 1247 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 ADH7P40394 386 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 TNS4Q8IZW8 715 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 UCN2Q96RP3 112 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 M0R2N6 131 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 ATP1A2P50993 1020 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 TBCELQ5QJ74 424 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 BRD7Q9NPI1 651 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 TYRO3Q06418 890 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 C9orf172C9J069 976 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 FAM229AH3BQW9 127 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 ATP9BO43861 1147 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 CCDC102BQ68D86 513 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 CEP63Q96MT8 703 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 EFCC1Q9HA90 598 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 LILRB5O75023 590 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 USP17L3A6NCW0 530 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 USP17L4A6NCW7 530 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC3-208ENST00000470815 ELNP15502 786 aa6.9□□□□□ -1.3
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