RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470527.1

CACHD1-202, Transcript of cache domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CACHD1, Length 5,260 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1-202ENST00000470527 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.37□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 KIAA1328Q86T90 577 aa7.37□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.37□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 GJB2P29033 226 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 NUCB1Q02818 461 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 PI4KAP2A4QPH2 592 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 GOLIM4O00461 696 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 CTAGE5O15320 804 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 IQCA1Q86XH1 822 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 TSPYL1Q9H0U9 437 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 A2MP01023 1474 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 GPTP24298 496 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 ANKRD62A6NC57 917 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 CNPY4Q8N129 248 aa7.36□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 POTEJP0CG39 1038 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 CCT2P78371 535 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 EXOC5O00471 708 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 ZSCAN12O43309 604 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 STX6O43752 255 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 ADAMTS2O95450 1211 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 CETN2P41208 172 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 ASXL2Q76L83 1435 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 KLHL10Q6JEL2 608 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 TAF4BQ92750 862 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 TSG101Q99816 390 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 CLIP2Q9UDT6 1046 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 KIAA0556O60303 1618 aa7.35□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 TNIP1Q15025 636 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 SLF2Q8IX21 1173 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 FSIP1Q8NA03 581 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 INCENPQ9NQS7 918 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 FBLN1P23142 703 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 PTPN14Q15678 1187 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 NEK1Q96PY6 1258 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 TOP1P11387 765 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 NLRP5P59047 1200 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 TMEM266Q2M3C6 531 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 CNNM3Q8NE01 707 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 RAB34Q9BZG1 259 aa7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CACHD1-202ENST00000470527 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.34□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 KIAA0754O94854 1291 aa7.34□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 SPA17Q15506 151 aa7.34□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 CCDC96Q2M329 555 aa7.34□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.33□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 UBXN4Q92575 508 aa7.33□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 MEIS3Q99687 375 aa7.33□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 TEX14Q8IWB6 1497 aa7.33□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 WDR7Q9Y4E6 1490 aa7.33□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 SDSP20132 328 aa7.33□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 STX1AQ16623 288 aa7.33□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 TAF3Q5VWG9 929 aa7.33□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 CENPHQ9H3R5 247 aa7.33□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 SNRKQ9NRH2 765 aa7.33□□□□□ -1.24
CACHD1-202ENST00000470527 USP16Q9Y5T5 823 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms