RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-208	ENST00000461648	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TSC2-208	ENST00000461648	FKBP8	Q14318	412 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TSC2-208	ENST00000461648	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TSC2-208	ENST00000461648	NUP98	P52948	1817 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TSC2-208	ENST00000461648	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TSC2-208	ENST00000461648	SPON1	Q9HCB6	807 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TSC2-208	ENST00000461648	RGL2	O15211	777 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TSC2-208	ENST00000461648	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TSC2-208	ENST00000461648	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TSC2-208	ENST00000461648	G2E3	Q7L622	706 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TSC2-208	ENST00000461648	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TSC2-208	ENST00000461648	HLF	Q16534	295 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TSC2-208	ENST00000461648	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	FLII	Q13045	1269 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	POLD1	P28340	1107 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	PTGER2	P43116	358 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	MMP10	P09238	476 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	TM4SF1	P30408	202 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	NFIX	Q14938	502 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TSC2-208	ENST00000461648	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	LRP5	O75197	1615 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	KSR2	Q6VAB6	950 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	DDR1	Q08345	913 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	SETDB2	Q96T68	719 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	32.55	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	ADCY9	O60503	1353 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	TCIRG1	Q13488	830 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TSC2-208	ENST00000461648	GPT	P24298	496 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	PTPRC	P08575	1304 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	BCAR3	O75815	825 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	SERPINB2	P05120	415 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	MYD88	Q99836	296 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	KIF16B	Q96L93	1317 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	PARP10	Q53GL7	1025 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648		F6X3S4	739 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TSC2-208	ENST00000461648	FAM177B	A6PVY3	158 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	NLRP10	Q86W26	655 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	SUSD4	Q5VX71	490 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	CNBD1	Q8NA66	436 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	NYX	Q9GZU5	481 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	NPHP1	O15259	732 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	NTSR2	O95665	410 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	IGKV5-2	P06315	115 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TSC2-208	ENST00000461648	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	LINS1	Q8NG48	757 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	BEND3	Q5T5X7	828 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	KLHL34	Q8N239	644 aa		32.37	■■■□□ 2.77

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