RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 SLX4Q8IY92 1834 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 BCORQ6W2J9 1755 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 MYL6BP14649 208 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 ERFEQ4G0M1 354 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 CNKSR1Q969H4 720 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 TIAM2Q8IVF5 1701 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 GLTPD2A6NH11 291 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 NBPF26B4DH59 902 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 NFKBIEO00221 500 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 HTRA3P83110 453 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 NFE2L2Q16236 605 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 CLEC4GQ6UXB4 293 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 NBPF15Q8N660 670 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 MASTLQ96GX5 879 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 NUP98P52948 1817 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 PRELPP51888 382 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 FSTL1Q12841 308 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 HLFQ16534 295 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 STYK1Q6J9G0 422 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 SMC1BQ8NDV3 1235 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 WDR90Q96KV7 1748 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 SRGNP10124 158 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 RIPK4P57078 832 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 NEUROD2Q15784 382 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 TAOK3Q9H2K8 898 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP1-204ENST00000459646 KDM3BQ7LBC6 1761 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 NPR1P16066 1061 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 GPTP24298 496 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 SOGA3Q5TF21 947 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 PLEKHF1Q96S99 279 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 TSPYL4Q9UJ04 414 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 RALBP1Q15311 655 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 TTLL7Q6ZT98 887 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 NECTIN2Q92692 538 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 ALDH1B1P30837 517 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC93Q567U6 631 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 NYXQ9GZU5 481 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 OLFM4Q6UX06 510 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 KLRG1Q96E93 195 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 ANXA1P04083 346 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 RTKN2Q8IZC4 609 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 SYNE4Q8N205 404 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 POTECB2RU33 542 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 SUSD4Q5VX71 490 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 JDP2Q8WYK2 163 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SH3BP1-204ENST00000459646 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 RGL2O15211 777 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 CHADLQ6NUI6 762 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 C7orf43Q8WVR3 580 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF428Q96B54 188 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 GJA3Q9Y6H8 435 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 SCN4AP35499 1836 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 IQCA1LA6NCM1 817 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 IARSP41252 1262 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 NLRP3Q96P20 1036 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 ABCC12Q96J65 1359 aa11.18□□□□□ -0.62
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