RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443090.1

GCSHP5-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP5, Length 522 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP5-201ENST00000443090 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 PCNTO95613 3336 aa26.55■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.55■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.55■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 CACNA1SQ13698 1873 aa26.54■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 SRGNP10124 158 aa26.54■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 ST5P78524 1137 aa26.54■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 STYK1Q6J9G0 422 aa26.54■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 JMYQ8N9B5 988 aa26.54■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 DCTN1Q14203 1278 aa26.53■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 CNKSR1Q969H4 720 aa26.53■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 POTECB2RU33 542 aa26.52■■□□□ 1.84
GCSHP5-201ENST00000443090 NBPF26B4DH59 902 aa26.51■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 RGL2O15211 777 aa26.51■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 NPHP1O15259 732 aa26.51■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 NBPF15Q8N660 670 aa26.51■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 MASTLQ96GX5 879 aa26.51■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 ERFEQ4G0M1 354 aa26.5■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.5■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.5■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.5■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.49■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.47■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 SOGA3Q5TF21 947 aa26.47■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.46■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.46■■□□□ 1.83
GCSHP5-201ENST00000443090 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
GCSHP5-201ENST00000443090 NPR1P16066 1061 aa26.43■■□□□ 1.82
GCSHP5-201ENST00000443090 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.43■■□□□ 1.82
GCSHP5-201ENST00000443090 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.42■■□□□ 1.82
GCSHP5-201ENST00000443090 HLFQ16534 295 aa26.41■■□□□ 1.82
GCSHP5-201ENST00000443090 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.41■■□□□ 1.82
GCSHP5-201ENST00000443090 CCDC93Q567U6 631 aa26.4■■□□□ 1.82
GCSHP5-201ENST00000443090 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
GCSHP5-201ENST00000443090 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
GCSHP5-201ENST00000443090 NEFMP07197 916 aa26.37■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 NUP98P52948 1817 aa26.37■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM177BA6PVY3 158 aa26.36■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 NFE2L2Q16236 605 aa26.36■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 SCN4AP35499 1836 aa26.35■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.35■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 CHADLQ6NUI6 762 aa26.35■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 ABCC12Q96J65 1359 aa26.34■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 POTEIP0CG38 1075 aa26.34■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 POTEJP0CG39 1038 aa26.34■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 OLFM4Q6UX06 510 aa26.34■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.34■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 SNED1Q8TER0 1413 aa26.33■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 CRY2Q49AN0 593 aa26.33■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
GCSHP5-201ENST00000443090 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.32■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.31■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.31■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 ALDH1B1P30837 517 aa26.31■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.31■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 NGEFQ8N5V2 710 aa26.31■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 NYXQ9GZU5 481 aa26.31■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.3■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.29■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.29■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 CREBZFQ9NS37 354 aa26.29■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 LDHDQ86WU2 507 aa26.28■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.28■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 ERBB4Q15303 1308 aa26.27■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.27■■□□□ 1.8
GCSHP5-201ENST00000443090 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.26■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 PASKQ96RG2 1323 aa26.26■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 MYL6BP14649 208 aa26.26■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 PSMD1Q99460 953 aa26.26■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 FZD9O00144 591 aa26.25■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 SYNE4Q8N205 404 aa26.25■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.25■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 GPTP24298 496 aa26.24■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.24■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 SUSD4Q5VX71 490 aa26.23■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.23■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
GCSHP5-201ENST00000443090 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms