RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442011.6

TGFBI-201, Transcript of transforming growth factor beta induced, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TGFBI, Length 2,804 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBI-201ENST00000442011 TIGD1Q96MW7 591 aa14.75□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.75□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.75□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.74□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.74□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 FOXO3O43524 673 aa14.74□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 PTPN14Q15678 1187 aa14.74□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 ME3Q16798 604 aa14.74□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.74□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 SOX12O15370 315 aa14.73□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 CNTROBQ8N137 903 aa14.73□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 ST3GAL1Q11201 340 aa14.73□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 FLIIQ13045 1269 aa14.73□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 BICD2Q8TD16 824 aa14.73□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 SPATA32Q96LK8 384 aa14.73□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.72□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.72□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.72□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 PTH1RQ03431 593 aa14.72□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.72□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 NR1I2O75469 434 aa14.71□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.71□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 AOX1Q06278 1338 aa14.71□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.71□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.71□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 SKILP12757 684 aa14.71□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 KLHL34Q8N239 644 aa14.71□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TGFBI-201ENST00000442011 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.71□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 VPS53Q5VIR6 699 aa14.7□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.7□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.7□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.7□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 GTF3C6Q969F1 213 aa14.7□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.7□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 ATP7BP35670 1465 aa14.7□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 PIK3C2BO00750 1634 aa14.7□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.7□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.7□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 USP16Q9Y5T5 823 aa14.7□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.69□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.69□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 ERO1AQ96HE7 468 aa14.69□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.69□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 STK3Q13188 491 aa14.68□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 USP44Q9H0E7 712 aa14.68□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 ELP1O95163 1332 aa14.68□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 CRB1P82279 1406 aa14.68□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 CCDC69A6NI79 296 aa14.68□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 RAB11FIP3O75154 756 aa14.68□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.68□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.68□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.67□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.67□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 A0A087WWV3 80 aa14.67□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.67□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 FBXW7Q969H0 707 aa14.67□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.67□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 SRGAP3O43295 1099 aa14.67□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.67□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 CAPN2P17655 700 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 SSH3Q8TE77 659 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 PGBD1Q96JS3 809 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.66□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 BECN2A8MW95 431 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 PDCP20941 246 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 ERBB3P21860 1342 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 CPS1P31327 1500 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 CDC25BP30305 580 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.65□□□□□ -0.06
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