RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441099.5

TRAPPC12-209, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC12, Length 698 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAPPC12-209ENST00000441099 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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TRAPPC12-209ENST00000441099 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC12-209ENST00000441099 TTLL6Q8N841 843 aa20.54■□□□□ 0.88
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TRAPPC12-209ENST00000441099 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC12-209ENST00000441099 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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TRAPPC12-209ENST00000441099 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.51■□□□□ 0.87
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TRAPPC12-209ENST00000441099 STK31Q9BXU1 1019 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC12-209ENST00000441099 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC12-209ENST00000441099 SLC4A2P04920 1241 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC12-209ENST00000441099 NPR1P16066 1061 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC12-209ENST00000441099 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC12-209ENST00000441099 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC12-209ENST00000441099 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC12-209ENST00000441099 CNKSR1Q969H4 720 aa20.49■□□□□ 0.87
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TRAPPC12-209ENST00000441099 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.48■□□□□ 0.87
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