RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439898.1

U73166.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene U73166.1, Length 2,625 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U73166.1-201ENST00000439898 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
U73166.1-201ENST00000439898 BRWD3Q6RI45 1802 aa20.65■□□□□ 0.9
U73166.1-201ENST00000439898 RXRBP28702 533 aa20.64■□□□□ 0.9
U73166.1-201ENST00000439898 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
U73166.1-201ENST00000439898 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
U73166.1-201ENST00000439898 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
U73166.1-201ENST00000439898 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.64■□□□□ 0.9
U73166.1-201ENST00000439898 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.64■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 ZNF790Q6PG37 636 aa20.62■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 MCM5P33992 734 aa20.62■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.62■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.61■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 IL16Q14005 1332 aa20.61■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 ITGB4P16144 1822 aa20.6■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 MCTP1Q6DN14 999 aa20.6■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 VAMP4O75379 141 aa20.6■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.6■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 TRIM27P14373 513 aa20.59■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 NUCB1Q02818 461 aa20.59■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 SMIM5Q71RC9 77 aa20.59■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.59■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.59■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 TRIM37O94972 964 aa20.58■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.58■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 LNPKQ9C0E8 428 aa20.58■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.58■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 ATG3Q9NT62 314 aa20.58■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.58■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.58■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 USP16Q9Y5T5 823 aa20.58■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 AK9Q5TCS8 1911 aa20.58■□□□□ 0.89
U73166.1-201ENST00000439898 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 RGS12O14924 1447 aa20.57■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 PROSER3Q2NL68 480 aa20.56■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.56■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.56■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.56■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 G2E3Q7L622 706 aa20.56■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.55■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.54■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.54■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 MYL6BP14649 208 aa20.54■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.54■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 UTRNP46939 3433 aa20.53■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.53■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 BCL9O00512 1426 aa20.53■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.52■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.52■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 GPT2Q8TD30 523 aa20.52■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.52■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 KIF16BQ96L93 1317 aa20.52■□□□□ 0.88
U73166.1-201ENST00000439898 SLC4A2P04920 1241 aa20.52■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 PKP1Q13835 747 aa20.52■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.52■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.52■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.51■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 A1BGP04217 495 aa20.51■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.51■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.51■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 TSC1Q92574 1164 aa20.51■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 NUCB2P80303 420 aa20.5■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 C5P01031 1676 aa20.5■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 MRC1P22897 1456 aa20.49■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.49■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 F6X3S4 739 aa20.49■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 CBX1P83916 185 aa20.49■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.48■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.48■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.47■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 SYCE3A1L190 88 aa20.47■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 KIF20AO95235 890 aa20.46■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 ATP6V1AP38606 617 aa20.46■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.46■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 PALLDQ8WX93 1383 aa20.46■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.45■□□□□ 0.87
U73166.1-201ENST00000439898 ITPK1Q13572 414 aa20.45■□□□□ 0.86
U73166.1-201ENST00000439898 ATP2B3Q16720 1220 aa20.45■□□□□ 0.86
U73166.1-201ENST00000439898 SBF2Q86WG5 1849 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms