RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438219.1

HCFC1-AS1-201, HCFC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCFC1-AS1, Length 350 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.65■□□□□ 0.58
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.65■□□□□ 0.58
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TTLL6Q8N841 843 aa18.64■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CHD4Q14839 1912 aa18.64■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PDE6BP35913 854 aa18.63■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PROSER3Q2NL68 480 aa18.63■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.63■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.63■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF652Q9Y2D9 606 aa18.63■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 APAF1O14727 1248 aa18.62■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ST5P78524 1137 aa18.62■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RNF181Q9P0P0 153 aa18.62■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CHL1O00533 1208 aa18.61■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GPTP24298 496 aa18.61■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PRELPP51888 382 aa18.61■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PDIA6Q15084 440 aa18.61■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C21orf2O43822 256 aa18.6■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KIF6Q6ZMV9 814 aa18.6■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa18.59■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.59■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SCN7AQ01118 1682 aa18.59■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DLG5Q8TDM6 1919 aa18.59■□□□□ 0.57
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SRGNP10124 158 aa18.58■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.58■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 BABAM1Q9NWV8 329 aa18.58■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NRXN2Q9P2S2 1712 aa18.57■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.57■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF428Q96B54 188 aa18.57■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.57■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.56■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ERVV-1B6SEH8 477 aa18.56■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NFKBIEO00221 500 aa18.56■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KIF3CO14782 793 aa18.56■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SUSD4Q5VX71 490 aa18.56■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.55■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ERFEQ4G0M1 354 aa18.55■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 STYK1Q6J9G0 422 aa18.55■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 COPS6Q7L5N1 327 aa18.55■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.55■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MASTLQ96GX5 879 aa18.55■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MBIPQ9NS73 344 aa18.55■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 OLFM4Q6UX06 510 aa18.54■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CNKSR1Q969H4 720 aa18.54■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ERBB4Q15303 1308 aa18.53■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RGL2O15211 777 aa18.53■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF34Q8IZ26 560 aa18.53■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CFAP44Q96MT7 982 aa18.53■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.53■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.53■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ABCC12Q96J65 1359 aa18.53■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LMNB1P20700 586 aa18.52■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.52■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ANP32CO43423 234 aa18.51■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NPR1P16066 1061 aa18.51■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.51■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.51■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLC51AQ86UW1 340 aa18.51■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RRAGCQ9HB90 399 aa18.51■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MRS2Q9HD23 443 aa18.51■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 BCORQ6W2J9 1755 aa18.5■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF853P0CG23 659 aa18.5■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NTSR2O95665 410 aa18.49■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C7orf43Q8WVR3 580 aa18.49■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NYXQ9GZU5 481 aa18.49■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa18.49■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LAMB4A4D0S4 1761 aa18.48■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SYNE4Q8N205 404 aa18.48■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 IFT57Q9NWB7 429 aa18.48■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.47■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.47■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GNAI1P63096 354 aa18.46■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa18.46■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KDM2BQ8NHM5 1336 aa18.46■□□□□ 0.55
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PARP10Q53GL7 1025 aa18.45■□□□□ 0.54
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.45■□□□□ 0.54
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NLRP10Q86W26 655 aa18.45■□□□□ 0.54
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa18.44■□□□□ 0.54
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TCIRG1Q13488 830 aa18.44■□□□□ 0.54
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CRY2Q49AN0 593 aa18.44■□□□□ 0.54
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CCDC93Q567U6 631 aa18.44■□□□□ 0.54
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GLTPD2A6NH11 291 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms