RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431095.5

H19-208, H19, imprinted maternally expressed transcript, human

TSL 5

Gene H19, Length 1,481 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
H19-208	ENST00000431095	DDR1	Q08345	913 aa		29.02	■■■□□ 2.24
H19-208	ENST00000431095	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		29.02	■■■□□ 2.24
H19-208	ENST00000431095	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		29.02	■■■□□ 2.24
H19-208	ENST00000431095	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		29.01	■■■□□ 2.24
H19-208	ENST00000431095	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		29.01	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		29.01	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	HYPK	Q9NX55	129 aa		29.01	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		29.01	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		29	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	SLFN5	Q08AF3	891 aa		28.99	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	COPS6	Q7L5N1	327 aa		28.99	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	HLF	Q16534	295 aa		28.98	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	VAMP4	O75379	141 aa		28.97	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		28.97	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		28.97	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	SETDB2	Q96T68	719 aa		28.97	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	SERPINB2	P05120	415 aa		28.96	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.96	■■■□□ 2.23
H19-208	ENST00000431095	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	28.95	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		28.95	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		28.94	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		28.94	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	STK31	Q9BXU1	1019 aa		28.93	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	28.92	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		28.92	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	ATP10D	Q9P241	1426 aa		28.91	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		28.91	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		28.91	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		28.9	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		28.9	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	NUP98	P52948	1817 aa		28.89	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	TGFB2	P61812	414 aa		28.89	■■■□□ 2.22
H19-208	ENST00000431095	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		28.88	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	SLC4A2	P04920	1241 aa		28.88	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		28.88	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		28.87	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	TCIRG1	Q13488	830 aa		28.85	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		28.85	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		28.85	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	CNBD1	Q8NA66	436 aa		28.85	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	PARP10	Q53GL7	1025 aa		28.84	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		28.83	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		28.83	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	ZNF428	Q96B54	188 aa		28.83	■■■□□ 2.21
H19-208	ENST00000431095	GPT	P24298	496 aa		28.82	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	CACNA1F	O60840	1977 aa		28.82	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.81	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	NPHP1	O15259	732 aa		28.81	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		28.81	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		28.81	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	NYX	Q9GZU5	481 aa		28.81	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	ST5	P78524	1137 aa		28.8	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	G2E3	Q7L622	706 aa		28.8	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	FLII	Q13045	1269 aa		28.79	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	SUSD4	Q5VX71	490 aa		28.79	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		28.79	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095		A0A0G2JLW4	131 aa		28.78	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	KSR2	Q6VAB6	950 aa		28.78	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	DPEP1	P16444	411 aa		28.78	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	PDE6B	P35913	854 aa		28.78	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	NLRP10	Q86W26	655 aa		28.78	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		28.78	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	FAM177B	A6PVY3	158 aa		28.77	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	KCNA3	P22001	575 aa		28.77	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		28.77	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		28.76	■■■□□ 2.2
H19-208	ENST00000431095	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		28.76	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		28.76	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	NTSR2	O95665	410 aa		28.76	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		28.76	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		28.76	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		28.75	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		28.75	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		28.75	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		28.74	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	ADCY9	O60503	1353 aa		28.74	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	CHRNA5	P30532	468 aa		28.73	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		28.73	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		28.72	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		28.72	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
H19-208	ENST00000431095		H0YIN7	160 aa		28.72	■■■□□ 2.19

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