RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 KIF2CQ99661 725 aa28.53■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.53■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 PAPPAQ13219 1627 aa28.53■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 STAP2Q9UGK3 403 aa28.52■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 PIGBQ92521 554 aa28.52■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.52■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa28.51■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 DISP2A7MBM2 1401 aa28.51■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 TNS2Q63HR2 1409 aa28.51■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.51■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 RILPL2Q969X0 211 aa28.51■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.5■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.5■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 PHLPP1O60346 1717 aa28.5■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.49■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.49■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.49■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 ERBB4Q15303 1308 aa28.48■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.47■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.47■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 KLHDC4Q8TBB5 520 aa28.47■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 USP26Q9BXU7 913 aa28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 EXOC5O00471 708 aa28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 HSCBQ8IWL3 235 aa28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 SIL1Q9H173 461 aa28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-209ENST00000428120 A0A087WZG4 1122 aa28.44■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 ATG3Q9NT62 314 aa28.44■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 PI4K2BQ8TCG2 481 aa28.44■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 AOX1Q06278 1338 aa28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 ERC2O15083 957 aa28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 ITGB4P16144 1822 aa28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 NFKBIBQ15653 356 aa28.42■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.41■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 TOM1O60784 492 aa28.4■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 SASH1O94885 1247 aa28.4■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 REC8O95072 547 aa28.4■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.4■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.4■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 CHMLP26374 656 aa28.4■■■□□ 2.14
FAAP20-209ENST00000428120 SNX21Q969T3 373 aa28.38■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa28.38■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 BCL9O00512 1426 aa28.38■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.37■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 AACSQ86V21 672 aa28.37■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.37■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 CASP7P55210 303 aa28.36■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 A0A0G2JS52 829 aa28.36■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 ARXQ96QS3 562 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 NRAPQ86VF7 1730 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 DDB1Q16531 1140 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 IL25Q9H293 177 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 AK9Q5TCS8 1911 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-209ENST00000428120 STARD3NLO95772 234 aa28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 H7C1W4 665 aa28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 LMBR1LQ6UX01 489 aa28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 ANO2Q9NQ90 1003 aa28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 CHMP3Q9Y3E7 222 aa28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 CNTROBQ8N137 903 aa28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 RABEP1Q15276 862 aa28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 COPRSQ9NQ92 184 aa28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 GPATCH3Q96I76 525 aa28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 FOXO4P98177 505 aa28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms