RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 ATP10AO60312 1499 aa16.85■□□□□ 0.29
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PTPRU-204ENST00000428026 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRU-204ENST00000428026 CEP131Q9UPN4 1083 aa16.79■□□□□ 0.28
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PTPRU-204ENST00000428026 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
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PTPRU-204ENST00000428026 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
PTPRU-204ENST00000428026 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.77■□□□□ 0.28
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PTPRU-204ENST00000428026 IGSF3O75054 1194 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRU-204ENST00000428026 CTAGE5O15320 804 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRU-204ENST00000428026 USP5P45974 858 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRU-204ENST00000428026 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
PTPRU-204ENST00000428026 MCM3P25205 808 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-204ENST00000428026 STX1AQ16623 288 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-204ENST00000428026 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-204ENST00000428026 V9GYY5 206 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-204ENST00000428026 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-204ENST00000428026 GNG11P61952 73 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-204ENST00000428026 FKBP15Q5T1M5 1219 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-204ENST00000428026 KRT222Q8N1A0 295 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-204ENST00000428026 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
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