RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGS19P49795 217 aa22.55■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC93Q567U6 631 aa22.55■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EPHX2P34913 555 aa22.54■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNTROBQ8N137 903 aa22.54■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCN7AQ01118 1682 aa22.53■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.53■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.53■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.53■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PANK3Q9H999 370 aa22.52■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLX4Q8IY92 1834 aa22.52■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.51■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.5■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.5■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.5■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.5■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ECE1P42892 770 aa22.49■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.49■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPR1P16066 1061 aa22.48■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.48■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAMTA2O94983 1202 aa22.47■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPC2Q8N158 579 aa22.47■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.47■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HMOX1P09601 288 aa22.46■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF790Q6PG37 636 aa22.46■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FZD9O00144 591 aa22.45■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAPNS2Q96L46 248 aa22.45■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CACNA1SQ13698 1873 aa22.45■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TEFQ10587 303 aa22.44■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.43■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.42■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JDP2Q8WYK2 163 aa22.42■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.42■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.42■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.42■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A1BGP04217 495 aa22.41■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.41■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALDH1B1P30837 517 aa22.4■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP2K2P36507 400 aa22.4■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.4■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYNE4Q8N205 404 aa22.4■■□□□ 1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CA12O43570 354 aa22.39■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.39■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRM1Q13255 1194 aa22.38■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFAP44Q96MT7 982 aa22.38■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMD1Q99460 953 aa22.38■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCORQ6W2J9 1755 aa22.37■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.36■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGL2O15211 777 aa22.36■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OLFM4Q6UX06 510 aa22.36■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.36■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.36■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.35■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL17REQ8NFR9 667 aa22.35■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.35■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.35■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CST9Q5W186 159 aa22.33■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.32■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSKSQ9UJT2 592 aa22.32■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EPS15P42566 896 aa22.31■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCNN1DP51172 638 aa22.31■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BTBD11A6QL63 1104 aa22.3■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AOC2O75106 756 aa22.3■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.3■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP16Q9Y5T5 823 aa22.3■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAF5O00463 557 aa22.29■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNED1Q8TER0 1413 aa22.29■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LTBP1Q14766 1721 aa22.28■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.28■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DGKZQ13574 1117 aa22.28■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.28■■□□□ 1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.28■■□□□ 1.16
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