RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421019.1

SMIM25-201, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM25, Length 686 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-201ENST00000421019 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.61□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 USP16Q9Y5T5 823 aa14.61□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 RGL2O15211 777 aa14.6□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.6□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 CREBZFQ9NS37 354 aa14.6□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.59□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 CCDC93Q567U6 631 aa14.59□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.59□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.59□□□□□ -0.07
SMIM25-201ENST00000421019 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 CAPN15O75808 1086 aa14.58□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 NPR1P16066 1061 aa14.58□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.57□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.57□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 SCN7AQ01118 1682 aa14.56□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 MCM10Q7L590 875 aa14.56□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 LDHDQ86WU2 507 aa14.56□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.56□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.55□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.55□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.55□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 POTEIP0CG38 1075 aa14.55□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 POTEJP0CG39 1038 aa14.55□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 NBPF26B4DH59 902 aa14.54□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 ALDH1B1P30837 517 aa14.54□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 NBPF15Q8N660 670 aa14.54□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 SLX4Q8IY92 1834 aa14.54□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 PASKQ96RG2 1323 aa14.53□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SMIM25-201ENST00000421019 FAM177BA6PVY3 158 aa14.52□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 PPP2R1AP30153 589 aa14.52□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 DCTN1Q14203 1278 aa14.52□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 HACL1Q9UJ83 578 aa14.52□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 CNTNAP1P78357 1384 aa14.51□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.51□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 SYNE4Q8N205 404 aa14.51□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 NYXQ9GZU5 481 aa14.51□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.5□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.5□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 FZD9O00144 591 aa14.5□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 NEFMP07197 916 aa14.5□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 EPHX2P34913 555 aa14.5□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 HLFQ16534 295 aa14.5□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.5□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.5□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 OLFM4Q6UX06 510 aa14.49□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 JDP2Q8WYK2 163 aa14.49□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 AIDAQ96BJ3 306 aa14.49□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 PSMD1Q99460 953 aa14.49□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.49□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 CRY2Q49AN0 593 aa14.48□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.48□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 GPC2Q8N158 579 aa14.48□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.48□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 BCORQ6W2J9 1755 aa14.47□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 FOXN1O15353 648 aa14.47□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 VEGFBP49765 207 aa14.47□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 CNTROBQ8N137 903 aa14.47□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 NGEFQ8N5V2 710 aa14.47□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 SCN4AP35499 1836 aa14.47□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 PCNTO95613 3336 aa14.46□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.46□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.46□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.46□□□□□ -0.09
SMIM25-201ENST00000421019 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.45□□□□□ -0.1
SMIM25-201ENST00000421019 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
SMIM25-201ENST00000421019 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.45□□□□□ -0.1
SMIM25-201ENST00000421019 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.45□□□□□ -0.1
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