RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-208ENST00000420964 KSR2Q6VAB6 950 aa15.61■□□□□ 0.09
FAAP20-208ENST00000420964 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.61■□□□□ 0.09
FAAP20-208ENST00000420964 DNAAF4Q8WXU2 420 aa15.61■□□□□ 0.09
FAAP20-208ENST00000420964 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa15.61■□□□□ 0.09
FAAP20-208ENST00000420964 KCNQ4P56696 695 aa15.6■□□□□ 0.09
FAAP20-208ENST00000420964 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
FAAP20-208ENST00000420964 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.6■□□□□ 0.09
FAAP20-208ENST00000420964 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa15.6■□□□□ 0.09
FAAP20-208ENST00000420964 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
FAAP20-208ENST00000420964 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
FAAP20-208ENST00000420964 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
FAAP20-208ENST00000420964 AAMPQ13685 434 aa15.58■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.58■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.58■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.58■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.58■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.58■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.58■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 PROM2Q8N271 834 aa15.57■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.57■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.57■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 BCORQ6W2J9 1755 aa15.57■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 BEND3Q5T5X7 828 aa15.56■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.56■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 COL15A1P39059 1388 aa15.56■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 SCN7AQ01118 1682 aa15.56■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 PLSCR1O15162 318 aa15.55■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.55■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.55■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa15.55■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.54■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.54■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 ALDH1L1O75891 902 aa15.54■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 TXNRD1Q16881 649 aa15.54■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 LINS1Q8NG48 757 aa15.54■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 MEIS3Q99687 375 aa15.54■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 MYD88Q99836 296 aa15.54■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 NUP98P52948 1817 aa15.54■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 C4AP0C0L4 1744 aa15.54■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 GNPATO15228 680 aa15.53■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.53■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.53■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 AK7Q96M32 723 aa15.53■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 ARXQ96QS3 562 aa15.53■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 A0A087WZG4 1122 aa15.52■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 IGKV5-2P06315 115 aa15.52■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
FAAP20-208ENST00000420964 NEURL1BA8MQ27 555 aa15.51■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.51■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 RPS6KA4O75676 772 aa15.51■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 C1orf115Q9H7X2 142 aa15.51■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.51■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.5■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa15.5■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 GNAI3P08754 354 aa15.5■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 USP44Q9H0E7 712 aa15.5■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.5■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 CAMTA2O94983 1202 aa15.49■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 TCIRG1Q13488 830 aa15.49■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 HLFQ16534 295 aa15.49■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.49■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 GRM8O00222 908 aa15.48■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 GCKRQ14397 625 aa15.48■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 AMIGO3Q86WK7 504 aa15.48■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 UTYO14607 1347 aa15.47■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 PHF14O94880 888 aa15.47■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 GNAI2P04899 355 aa15.47■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 ADRA2BP18089 450 aa15.47■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 SMIM5Q71RC9 77 aa15.47■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.47■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.47■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.47■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 RGL2O15211 777 aa15.46■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 CASZ1Q86V15 1759 aa15.46■□□□□ 0.07
FAAP20-208ENST00000420964 SSFA2P28290 1259 aa15.45■□□□□ 0.06
FAAP20-208ENST00000420964 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
FAAP20-208ENST00000420964 ZNF827Q17R98 1081 aa15.45■□□□□ 0.06
FAAP20-208ENST00000420964 TRAPPC3LQ5T215 181 aa15.45■□□□□ 0.06
FAAP20-208ENST00000420964 AKT1S1Q96B36 256 aa15.45■□□□□ 0.06
FAAP20-208ENST00000420964 NARFQ9UHQ1 456 aa15.45■□□□□ 0.06
FAAP20-208ENST00000420964 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.45■□□□□ 0.06
FAAP20-208ENST00000420964 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms