RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 IFNL2Q8IZJ0 200 aa4.96□□□□□ -1.61
LRRTM4-201ENST00000409088 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa4.96□□□□□ -1.61
LRRTM4-201ENST00000409088 RIMBP2O15034 1052 aa4.96□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 GNAI2P04899 355 aa4.96□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 SMYD5Q6GMV2 418 aa4.96□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 CHMP4AQ9BY43 222 aa4.96□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC37A3O60309 1634 aa4.96□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 PI4KAP2A4QPH2 592 aa4.96□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 GNAI3P08754 354 aa4.96□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXB7P09629 217 aa4.96□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa4.96□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 STRN4Q9NRL3 753 aa4.96□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 RGPD5Q99666 1765 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP27B1O15528 508 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 HMMRO75330 724 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 CPDO75976 1380 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP10DQ9P241 1426 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 MEGF6O75095 1541 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 EVA1CP58658 441 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF790Q6PG37 636 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC52A2Q9HAB3 445 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 PROSER3Q2NL68 480 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAAF4Q8WXU2 420 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 USP44Q9H0E7 712 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 USP35Q9P2H5 1018 aa4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 NBR1Q14596 966 aa4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 BMP2KLQ5H9B9 411 aa4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 DCAF5Q96JK2 942 aa4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR17Q8IZU2 1322 aa4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 CABP4P57796 275 aa4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC5Q8N0Z6 440 aa4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 MYL6BP14649 208 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP8B2P98198 1209 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 TBC1D32Q96NH3 1257 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 LMO7Q8WWI1 1683 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 BEND3Q5T5X7 828 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 COL18A1P39060 1754 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 HEG1Q9ULI3 1381 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 DPY19L2Q6NUT2 758 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 HYPKQ9NX55 129 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 USP16Q9Y5T5 823 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 IL2RBP14784 551 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 E2F4Q16254 413 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 KSR2Q6VAB6 950 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 CARD10Q9BWT7 1032 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 ADCY9O60503 1353 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX58O95786 925 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 PBX2P40425 430 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 PDIA6Q15084 440 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR153Q6NV75 609 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 RIC3Q7Z5B4 369 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 FMNL2Q96PY5 1086 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR70Q9NW82 654 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 BTG4Q9NY30 223 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 SRGAP3O43295 1099 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 BECN1Q14457 450 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC22Q5TAA0 569 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 COPS6Q7L5N1 327 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRCC1Q9C099 1032 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 KDM3BQ7LBC6 1761 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms