RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1E-204	ENST00000403904	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	42.45	■■■■■ 4.39
CSNK1E-204	ENST00000403904	MSH5	O43196	834 aa		42.44	■■■■■ 4.39
CSNK1E-204	ENST00000403904	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.39
CSNK1E-204	ENST00000403904	NARF	Q9UHQ1	456 aa		42.44	■■■■■ 4.39
CSNK1E-204	ENST00000403904	PTPRC	P08575	1304 aa		42.44	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		42.44	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZPR1	O75312	459 aa		42.42	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	CAMTA2	O94983	1202 aa		42.42	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		42.42	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		42.42	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	KSR2	Q6VAB6	950 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	ADCY9	O60503	1353 aa		42.4	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		42.4	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	HLF	Q16534	295 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904		F6X3S4	739 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	42.39	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	42.39	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		42.38	■■■■■ 4.38
CSNK1E-204	ENST00000403904	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		42.38	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	PLIN1	O60240	522 aa		42.38	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	SCN7A	Q01118	1682 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	NUP98	P52948	1817 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		42.35	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		42.35	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	TNN	Q9UQP3	1299 aa		42.35	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	42.34	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	TRIM27	P14373	513 aa		42.34	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	GYS1	P13807	737 aa		42.32	■■■■■ 4.37
CSNK1E-204	ENST00000403904	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		42.31	■■■■■ 4.36
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		42.31	■■■■■ 4.36
CSNK1E-204	ENST00000403904	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CSNK1E-204	ENST00000403904	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	42.3	■■■■■ 4.36
CSNK1E-204	ENST00000403904	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	42.3	■■■■■ 4.36
CSNK1E-204	ENST00000403904	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	42.29	■■■■■ 4.36
CSNK1E-204	ENST00000403904	FKBP8	Q14318	412 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CSNK1E-204	ENST00000403904	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CSNK1E-204	ENST00000403904	MYD88	Q99836	296 aa		42.28	■■■■■ 4.36
CSNK1E-204	ENST00000403904	TCIRG1	Q13488	830 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CSNK1E-204	ENST00000403904	CASZ1	Q86V15	1759 aa		42.25	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	RGL2	O15211	777 aa		42.25	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	GPT	P24298	496 aa		42.23	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		42.23	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	ABCC4	O15439	1325 aa		42.23	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	MSL1	Q68DK7	614 aa		42.22	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		42.22	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		42.22	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	BEND3	Q5T5X7	828 aa		42.21	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	42.21	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	ATP10D	Q9P241	1426 aa		42.21	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	IGKV5-2	P06315	115 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	RLBP1	P12271	317 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CSNK1E-204	ENST00000403904	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	42.19	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	PANK1	Q8TE04	598 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	LINS1	Q8NG48	757 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	42.17	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	NFIX	Q14938	502 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	ZBTB7A	O95365	584 aa		42.16	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		42.16	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	MS4A1	P11836	297 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	SETDB2	Q96T68	719 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	TM4SF1	P30408	202 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	NLRP10	Q86W26	655 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	42.13	■■■■■ 4.34
CSNK1E-204	ENST00000403904	PDE3A	Q14432	1141 aa		42.13	■■■■■ 4.33
CSNK1E-204	ENST00000403904	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.33
CSNK1E-204	ENST00000403904	FAM177B	A6PVY3	158 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CSNK1E-204	ENST00000403904	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CSNK1E-204	ENST00000403904	PARP10	Q53GL7	1025 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CSNK1E-204	ENST00000403904	MTFR1L	Q9H019	292 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CSNK1E-204	ENST00000403904	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	42.1	■■■■■ 4.33
CSNK1E-204	ENST00000403904	ALDH1L1	O75891	902 aa		42.09	■■■■■ 4.33

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