RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395564.8

UPP1-203, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-203ENST00000395564 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 SLC4A2P04920 1241 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 FKBP8Q14318 412 aa23.05■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 POLD1P28340 1107 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 MSL1Q68DK7 614 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 PTGER2P43116 358 aa23.02■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
UPP1-203ENST00000395564 TM4SF1P30408 202 aa23.01■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 FLIIQ13045 1269 aa23.01■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 HLFQ16534 295 aa23.01■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.01■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.01■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.01■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 NUP98P52948 1817 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 ATP10DQ9P241 1426 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 LRP5O75197 1615 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 MMP10P09238 476 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 RARSP54136 660 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 NFIXQ14938 502 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 G2E3Q7L622 706 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 KSR2Q6VAB6 950 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 SETDB2Q96T68 719 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.97■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 TCIRG1Q13488 830 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 PTPRCP08575 1304 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-203ENST00000395564 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 DDR1Q08345 913 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 PARP10Q53GL7 1025 aa22.94■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.94■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.94■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 ADCY9O60503 1353 aa22.94■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 KIF16BQ96L93 1317 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 SERPINB2P05120 415 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.92■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.91■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.9■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 GPTP24298 496 aa22.9■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.9■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 NYXQ9GZU5 481 aa22.9■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.89■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 NLRP10Q86W26 655 aa22.89■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.89■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 MYD88Q99836 296 aa22.89■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
UPP1-203ENST00000395564 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.89■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.89■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 BCAR3O75815 825 aa22.88■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 CNBD1Q8NA66 436 aa22.88■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.88■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.87■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 SUSD4Q5VX71 490 aa22.87■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.87■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.87■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.87■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.87■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 F6X3S4 739 aa22.86■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 LINS1Q8NG48 757 aa22.86■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.85■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 NPHP1O15259 732 aa22.85■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 NTSR2O95665 410 aa22.85■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 IGKV5-2P06315 115 aa22.85■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 ST5P78524 1137 aa22.85■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.84■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 BEND3Q5T5X7 828 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms