RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 H3BQF6 201 aa11.2□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 SMC2O95347 1197 aa11.2□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.19□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 BICD2Q8TD16 824 aa11.19□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 TPM1P09493 284 aa11.19□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC30Q5VVM6 783 aa11.19□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.19□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 CORO7P57737 925 aa11.18□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC102AQ96A19 550 aa11.18□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC189A1A4V9 331 aa11.18□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 H0YHG0 523 aa11.18□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 NEMFO60524 1076 aa11.18□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 GSCP56915 257 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 SARNPP82979 210 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 FBXW10Q5XX13 1052 aa11.18□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 RABEP2Q9H5N1 569 aa11.18□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 CCZ1BP86790 482 aa11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 TADA2BQ86TJ2 420 aa11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC83Q8IWF9 413 aa11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 CEP120Q8N960 986 aa11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 ERLIN2O94905 339 aa11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 GBP6Q6ZN66 633 aa11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 HOMEZQ8IX15 550 aa11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 FAN1Q9Y2M0 1017 aa11.17□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.16□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 ELP1O95163 1332 aa11.16□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 PDE6BP35913 854 aa11.16□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 CEP89Q96ST8 783 aa11.16□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.16□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 CPA1P15085 419 aa11.16□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 TTC6Q86TZ1 520 aa11.16□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 CALRP27797 417 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 PTPRGP23470 1445 aa11.15□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 GLI2P10070 1586 aa11.15□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 A2MP01023 1474 aa11.15□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.15□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 NRDCO43847 1150 aa11.15□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 GJB2P29033 226 aa11.15□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.15□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.15□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa11.15□□□□□ -0.62
TMOD1-203ENST00000395211 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.15□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 KRT85P78386 507 aa11.15□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 HSP90B2PQ58FF3 399 aa11.15□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.15□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.14□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 ATP2B2Q01814 1243 aa11.14□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 LONRF2Q1L5Z9 754 aa11.14□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC158Q5M9N0 1113 aa11.14□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 TMC6Q7Z403 805 aa11.14□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.14□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 DCTPP1Q9H773 170 aa11.14□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 TADA3O75528 432 aa11.14□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.14□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 NBPF20Q3BBV1 942 aa11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 IQUBQ8NA54 791 aa11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 PLCD4Q9BRC7 762 aa11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 PAX7P23759 505 aa11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 RDXP35241 583 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 USP8P40818 1118 aa11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 CNNM3Q8NE01 707 aa11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 KAT2BQ92831 832 aa11.13□□□□□ -0.63
TMOD1-203ENST00000395211 FUT8Q9BYC5 575 aa11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms