RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379565.7

RPS6KA3-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KA3, Length 7,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3-201ENST00000379565 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 LMAN1P49257 510 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 OGFOD1Q8N543 542 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 KIF5BP33176 963 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 NF2P35240 595 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 HAND2P61296 217 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 PICALMQ13492 652 aa20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 NAIPQ13075 1403 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 CNNM3Q8NE01 707 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 SYNCQ9H7C4 482 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 STX8Q9UNK0 236 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 INCENPQ9NQS7 918 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 VEZTQ9HBM0 779 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS6KA3-201ENST00000379565 PPFIA3O75145 1194 aa20.2■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 PANK2Q9BZ23 570 aa20.2■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.2■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC174Q6PII3 467 aa20.2■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 AKNAQ7Z591 1439 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 ATP6V1AP38606 617 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 SETDB2Q96T68 719 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 KIF5CO60282 957 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 SYCE3A1L190 88 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 CASQ1P31415 396 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 MICU3Q86XE3 530 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.822e-7■■■■□ 23.6
RPS6KA3-201ENST00000379565 AMPD3Q01432 767 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 POLD1P28340 1107 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 TSPY3P0CV98 308 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 TSPY8P0CW00 308 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 GSTO1P78417 241 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.16■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 DPH6Q7L8W6 267 aa20.16■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 UBXN4Q92575 508 aa20.16■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANO10Q9NW15 660 aa20.16■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 PHACTR2O75167 634 aa20.16■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 CEP63Q96MT8 703 aa20.16■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.15■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.15■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 TOM1O60784 492 aa20.15■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.15■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 MYZAPP0CAP1 466 aa20.15■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.14■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 BIN1O00499 593 aa20.14■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 STX6O43752 255 aa20.14■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 UBA7P41226 1012 aa20.14■□□□□ 0.82
RPS6KA3-201ENST00000379565 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RPS6KA3-201ENST00000379565 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.14■□□□□ 0.81
RPS6KA3-201ENST00000379565 ISM2Q6H9L7 571 aa20.14■□□□□ 0.81
RPS6KA3-201ENST00000379565 YEATS4O95619 227 aa20.14■□□□□ 0.81
RPS6KA3-201ENST00000379565 OTUD6BQ8N6M0 293 aa20.14■□□□□ 0.81
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.14■□□□□ 0.81
RPS6KA3-201ENST00000379565 SPECC1Q5M775 1068 aa20.13■□□□□ 0.81
RPS6KA3-201ENST00000379565 USP16Q9Y5T5 823 aa20.13■□□□□ 0.81
RPS6KA3-201ENST00000379565 ACTN2P35609 894 aa20.13■□□□□ 0.81
RPS6KA3-201ENST00000379565 PAFAH1B1P43034 410 aa20.13■□□□□ 0.81
RPS6KA3-201ENST00000379565 RGS22Q8NE09 1264 aa20.13■□□□□ 0.81
RPS6KA3-201ENST00000379565 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.811e-8■■□□□ 11.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.4 ms