RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRC-204ENST00000367379 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRC-204ENST00000367379 CLDN10P78369 228 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRC-204ENST00000367379 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRC-204ENST00000367379 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRC-204ENST00000367379 TPCN2Q8NHX9 752 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRC-204ENST00000367379 PRR12Q9ULL5 1215 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRC-204ENST00000367379 SERTM1A2A2V5 107 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 ATP1A2P50993 1020 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 CCDC102BQ68D86 513 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 M0R2N6 131 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 ATP9BO43861 1147 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 CD163Q86VB7 1156 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF232Q9UNY5 417 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 ELOA3BQ3SY89 546 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 C1orf53Q5VUE5 145 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 LARGE2Q8N3Y3 721 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 ELOA3Q8NG57 546 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 TRIM11Q96F44 468 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 SYT9Q86SS6 491 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 SIN3BO75182 1162 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 DKK1O94907 266 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 CHRNA4P43681 627 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 SIX5Q8N196 739 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 OGFOD1Q8N543 542 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 RHPN1Q8TCX5 695 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRC-204ENST00000367379 SLC30A3Q99726 388 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 NEUROD4Q9HD90 331 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 FURINP09958 794 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 TNFRSF25Q93038 417 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 C21orf2O43822 256 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 ALAS2P22557 587 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 KCNQ4P56696 695 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 PLVAPQ9BX97 442 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 PHACTR1Q9C0D0 580 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 SPEM2Q0P670 501 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 STAG2Q8N3U4 1231 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 HSH2DQ96JZ2 352 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 STARD13Q9Y3M8 1113 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 SFI1A8K8P3 1242 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 TYRO3Q06418 890 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF280CQ8ND82 737 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 SUSD3Q96L08 255 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 BRD7Q9NPI1 651 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 PRDM6Q9NQX0 595 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRC-204ENST00000367379 CEP63Q96MT8 703 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 XP32Q5T750 250 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 GAS2L2Q8NHY3 880 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 GLMNQ92990 594 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 CLUAP1Q96AJ1 413 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 KCNH4Q9UQ05 1017 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 ATAD2Q6PL18 1390 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 SPDYE3A6NKU9 549 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 M0R082 166 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 ADH7P40394 386 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 NEUROD1Q13562 356 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 MICALL1Q8N3F8 863 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF417Q8TAU3 575 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 ALBP02768 609 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 RASA1P20936 1047 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 ITGB7P26010 798 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 SEC13P55735 322 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 C20orf204Q6ZNR8 217 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 NID1P14543 1247 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 C8orf86Q6ZUL3 223 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 BTLAQ7Z6A9 289 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRC-204ENST00000367379 GATA4P43694 442 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 DOC2BQ14184 412 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 HIF1AQ16665 826 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 PRRT3Q5FWE3 981 aa10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms