RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358966.6

GGPS1-202, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GGPS1, Length 2,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-202ENST00000358966 SURF6O75683 361 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
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GGPS1-202ENST00000358966 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.62■□□□□ 0.09
GGPS1-202ENST00000358966 KAZALD1Q96I82 304 aa15.62■□□□□ 0.09
GGPS1-202ENST00000358966 SUCLG2Q96I99 432 aa15.62■□□□□ 0.09
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GGPS1-202ENST00000358966 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa15.54■□□□□ 0.08
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GGPS1-202ENST00000358966 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
GGPS1-202ENST00000358966 BCL9LQ86UU0 1499 aa15.49■□□□□ 0.07
GGPS1-202ENST00000358966 SASH1O94885 1247 aa15.49■□□□□ 0.07
GGPS1-202ENST00000358966 HLFQ16534 295 aa15.49■□□□□ 0.07
GGPS1-202ENST00000358966 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
GGPS1-202ENST00000358966 TBC1D2Q9BYX2 928 aa15.49■□□□□ 0.07
GGPS1-202ENST00000358966 SMIM5Q71RC9 77 aa15.48■□□□□ 0.07
GGPS1-202ENST00000358966 KLHL34Q8N239 644 aa15.48■□□□□ 0.07
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