RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 CTR9Q6PD62 1173 aa18.55■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 FERMT2Q96AC1 680 aa18.55■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 MAATS1Q7Z4T9 603 aa18.54■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 HOMER2Q9NSB8 354 aa18.54■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 CCDC40Q4G0X9 1142 aa18.54■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 ADAMTS2O95450 1211 aa18.54■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 SLFN5Q08AF3 891 aa18.54■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 ZNF652Q9Y2D9 606 aa18.54■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 ERBINQ96RT1 1412 aa18.54■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 NOP2P46087 812 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.53■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa18.53■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 IDEP14735 1019 aa18.53■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 CETN1Q12798 172 aa18.53■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.53■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 PANK2Q9BZ23 570 aa18.53■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.53■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 GDPD2Q9HCC8 539 aa18.52■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 FSD2A1L4K1 749 aa18.52■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 ZPR1O75312 459 aa18.52■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 SERPINA10Q9UK55 444 aa18.52■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.52■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
RXRA-201ENST00000356384 POTEB2H3BUK9 544 aa18.52■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 PRC1O43663 620 aa18.51■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 GSDMDP57764 484 aa18.51■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 CATIPQ7Z7H3 387 aa18.51■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 FAM107BQ9H098 131 aa18.51■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 ISM2Q6H9L7 571 aa18.51■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa18.51■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 HFM1A2PYH4 1435 aa18.51■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 SLC5A1P13866 664 aa18.51■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 CALML4Q96GE6 196 aa18.51■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 TMOD3Q9NYL9 352 aa18.51■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 NEMFO60524 1076 aa18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 GRIPAP1Q4V328 841 aa18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 DRC1Q96MC2 740 aa18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 MYO1BO43795 1136 aa18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 STX1AQ16623 288 aa18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 CCDC184Q52MB2 194 aa18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 JADE2Q9NQC1 790 aa18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 A0A087WZG4 1122 aa18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 EHMT1Q9H9B1 1298 aa18.5■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 F6X3S4 739 aa18.49■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 LMAN1P49257 510 aa18.49■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 GPATCH11Q8N954 259 aa18.49■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 SKAP1Q86WV1 359 aa18.49■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 ADCY5O95622 1261 aa18.49■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 GJB2P29033 226 aa18.49■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa18.49■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 AMPD3Q01432 767 aa18.49■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 USHBP1Q8N6Y0 703 aa18.48■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 TMEM87AQ8NBN3 555 aa18.48■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 VAT1LQ9HCJ6 419 aa18.48■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa18.48■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 ATAD2Q6PL18 1390 aa18.48■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.48■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.48■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 FERP16591 822 aa18.48■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.48■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 SYCP3Q8IZU3 236 aa18.47■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 DAPK1P53355 1430 aa18.47■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 NSD3Q9BZ95 1437 aa18.47■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 PPFIA3O75145 1194 aa18.47■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 ATP2C2O75185 946 aa18.47■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 CEP112Q8N8E3 955 aa18.47■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 TTC16Q8NEE8 873 aa18.47■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa18.47■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 USP16Q9Y5T5 823 aa18.47■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 C6orf163Q5TEZ5 329 aa18.46■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 TSNARE1Q96NA8 513 aa18.46■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 MMRN2Q9H8L6 949 aa18.46■□□□□ 0.55
RXRA-201ENST00000356384 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.5 ms