RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 EVI5LQ96CN4 794 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 BIN1O00499 593 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 GJB2P29033 226 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 FSIP1Q8NA03 581 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM27P14373 513 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 ANXA1P04083 346 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC150Q8NCX0 1101 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 PRXQ9BXM0 1461 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
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PTPRM-201ENST00000332175 ISM2Q6H9L7 571 aa25.91■■□□□ 1.74
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PTPRM-201ENST00000332175 TSPY2A6NKD2 308 aa25.9■■□□□ 1.74
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PTPRM-201ENST00000332175 KIF14Q15058 1648 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 PTPN14Q15678 1187 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 KAT14Q9H8E8 782 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 RFC4P35249 363 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 PTPRCP08575 1304 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 DYDC1Q8WWB3 177 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 USP16Q9Y5T5 823 aa25.89■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 ZSCAN12O43309 604 aa25.89■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 VPS36Q86VN1 386 aa25.89■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 MICU3Q86XE3 530 aa25.89■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 FBLN1P23142 703 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 URI1O94763 535 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
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PTPRM-201ENST00000332175 IDI1Q13907 227 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 MBIPQ9NS73 344 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 NOS1P29475 1434 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 USP8P40818 1118 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 CRACR2AQ9BSW2 395 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 ESPNB1AK53 854 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
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PTPRM-201ENST00000332175 LUZP1Q86V48 1076 aa25.87■■□□□ 1.73
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PTPRM-201ENST00000332175 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.87■■□□□ 1.73
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 CALML4Q96GE6 196 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 IDEP14735 1019 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 PDE4BQ07343 736 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC40Q4G0X9 1142 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 CABP5Q9NP86 173 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 BAG3O95817 575 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 TMCO3Q6UWJ1 677 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 FERMT2Q96AC1 680 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC91Q7Z6B0 441 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 ACEP12821 1306 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRM-201ENST00000332175 F8W031 263 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 KIF5BP33176 963 aa25.83■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 ST5P78524 1137 aa25.83■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 ABCC5O15440 1437 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 YEATS4O95619 227 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 IFFO1Q0D2I5 559 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRM-201ENST00000332175 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.82■■□□□ 1.72
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