RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 RILPL2Q969X0 211 aa21.65■■□□□ 1.06
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PKP3-201ENST00000331563 AP5Z1O43299 807 aa21.65■■□□□ 1.06
PKP3-201ENST00000331563 PTGS1P23219 599 aa21.65■■□□□ 1.06
PKP3-201ENST00000331563 CERS3Q8IU89 383 aa21.65■■□□□ 1.06
PKP3-201ENST00000331563 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.64■■□□□ 1.05
PKP3-201ENST00000331563 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.64■■□□□ 1.05
PKP3-201ENST00000331563 CAPN2P17655 700 aa21.63■■□□□ 1.05
PKP3-201ENST00000331563 PDE1AP54750 535 aa21.63■■□□□ 1.05
PKP3-201ENST00000331563 TERF2Q15554 542 aa21.63■■□□□ 1.05
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PKP3-201ENST00000331563 ZNF592Q92610 1267 aa21.61■■□□□ 1.05
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PKP3-201ENST00000331563 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.6■■□□□ 1.05
PKP3-201ENST00000331563 HMMRO75330 724 aa21.6■■□□□ 1.05
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PKP3-201ENST00000331563 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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PKP3-201ENST00000331563 CHL1O00533 1208 aa21.59■■□□□ 1.05
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PKP3-201ENST00000331563 NBPF4Q96M43 638 aa21.58■■□□□ 1.05
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PKP3-201ENST00000331563 TCHHQ07283 1943 aa21.58■■□□□ 1.04
PKP3-201ENST00000331563 ATP10DQ9P241 1426 aa21.58■■□□□ 1.04
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PKP3-201ENST00000331563 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.57■■□□□ 1.04
PKP3-201ENST00000331563 ARHGEF10O15013 1369 aa21.57■■□□□ 1.04
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PKP3-201ENST00000331563 STX6O43752 255 aa21.57■■□□□ 1.04
PKP3-201ENST00000331563 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PKP3-201ENST00000331563 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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PKP3-201ENST00000331563 RGS12O14924 1447 aa21.56■■□□□ 1.04
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PKP3-201ENST00000331563 KRT222Q8N1A0 295 aa21.56■■□□□ 1.04
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PKP3-201ENST00000331563 MSH6P52701 1360 aa21.55■■□□□ 1.04
PKP3-201ENST00000331563 GCP02774 474 aa21.55■■□□□ 1.04
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PKP3-201ENST00000331563 F13A1P00488 732 aa21.53■■□□□ 1.04
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PKP3-201ENST00000331563 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.53■■□□□ 1.04
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PKP3-201ENST00000331563 TRIM5Q9C035 493 aa21.53■■□□□ 1.04
PKP3-201ENST00000331563 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.53■■□□□ 1.04
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PKP3-201ENST00000331563 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.52■■□□□ 1.04
PKP3-201ENST00000331563 IP6K1Q92551 441 aa21.52■■□□□ 1.04
PKP3-201ENST00000331563 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
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PKP3-201ENST00000331563 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.52■■□□□ 1.04
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PKP3-201ENST00000331563 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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PKP3-201ENST00000331563 G2E3Q7L622 706 aa21.51■■□□□ 1.03
PKP3-201ENST00000331563 ATF3P18847 181 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP3-201ENST00000331563 F6X3S4 739 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-201ENST00000331563 LGR6Q9HBX8 967 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-201ENST00000331563 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PKP3-201ENST00000331563 CEP135Q66GS9 1140 aa21.49■■□□□ 1.03
PKP3-201ENST00000331563 MAP3K11Q16584 847 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-201ENST00000331563 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP3-201ENST00000331563 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.48■■□□□ 1.03
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