RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 COPS6Q7L5N1 327 aa25.97■■□□□ 1.75
RAB11B-201ENST00000328024 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.97■■□□□ 1.75
RAB11B-201ENST00000328024 TM4SF1P30408 202 aa25.97■■□□□ 1.75
RAB11B-201ENST00000328024 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
RAB11B-201ENST00000328024 BCORQ6W2J9 1755 aa25.96■■□□□ 1.75
RAB11B-201ENST00000328024 MMP10P09238 476 aa25.96■■□□□ 1.75
RAB11B-201ENST00000328024 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
RAB11B-201ENST00000328024 DDR1Q08345 913 aa25.95■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 NFIXQ14938 502 aa25.95■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.95■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.95■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.94■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 POLD1P28340 1107 aa25.94■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 HYPKQ9NX55 129 aa25.94■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.92■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 SLC4A2P04920 1241 aa25.92■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.92■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.92■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 G2E3Q7L622 706 aa25.92■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.91■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.9■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 STK31Q9BXU1 1019 aa25.9■■□□□ 1.74
RAB11B-201ENST00000328024 NUP98P52948 1817 aa25.88■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 RGL2O15211 777 aa25.87■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.87■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.87■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.86■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.86■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 SERPINB2P05120 415 aa25.84■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.84■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.84■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 SETDB2Q96T68 719 aa25.84■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
RAB11B-201ENST00000328024 ATP10DQ9P241 1426 aa25.82■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.82■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 GPTP24298 496 aa25.82■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 FLIIQ13045 1269 aa25.82■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.82■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.81■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 TCIRG1Q13488 830 aa25.81■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 KLHL34Q8N239 644 aa25.81■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 CACNA1FO60840 1977 aa25.81■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 ADCY9O60503 1353 aa25.8■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.8■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.8■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 SYT17Q9BSW7 474 aa25.8■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.8■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.79■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.79■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.79■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF428Q96B54 188 aa25.79■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 FAM177BA6PVY3 158 aa25.79■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 SUSD4Q5VX71 490 aa25.79■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 KSR2Q6VAB6 950 aa25.79■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.78■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.78■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.78■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.78■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.77■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.77■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.77■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.77■■□□□ 1.72
RAB11B-201ENST00000328024 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.76■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.76■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 NLRP10Q86W26 655 aa25.76■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.75■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 MYD88Q99836 296 aa25.74■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.74■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 F6X3S4 739 aa25.74■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 NTSR2O95665 410 aa25.73■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 PARP10Q53GL7 1025 aa25.73■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.73■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 CNBD1Q8NA66 436 aa25.73■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.72■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 IGKV5-2P06315 115 aa25.72■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.71■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 BCAR3O75815 825 aa25.71■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 SYNE4Q8N205 404 aa25.71■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.71■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.71■■□□□ 1.71
RAB11B-201ENST00000328024 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
RAB11B-201ENST00000328024 ERFEQ4G0M1 354 aa25.7■■□□□ 1.7
RAB11B-201ENST00000328024 ABCC12Q96J65 1359 aa25.69■■□□□ 1.7
RAB11B-201ENST00000328024 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.69■■□□□ 1.7
RAB11B-201ENST00000328024 A0A0G2JLW4 131 aa25.69■■□□□ 1.7
RAB11B-201ENST00000328024 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.69■■□□□ 1.7
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