RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 CHADLQ6NUI6 762 aa22.11■■□□□ 1.13
SFTPC-201ENST00000318561 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.11■■□□□ 1.13
SFTPC-201ENST00000318561 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.11■■□□□ 1.13
SFTPC-201ENST00000318561 POTEIP0CG38 1075 aa22.1■■□□□ 1.13
SFTPC-201ENST00000318561 POTEJP0CG39 1038 aa22.1■■□□□ 1.13
SFTPC-201ENST00000318561 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SFTPC-201ENST00000318561 VEGFBP49765 207 aa22.1■■□□□ 1.13
SFTPC-201ENST00000318561 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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SFTPC-201ENST00000318561 WBP1LQ9NX94 342 aa22.1■■□□□ 1.13
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SFTPC-201ENST00000318561 CCDC27Q2M243 656 aa22.08■■□□□ 1.13
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SFTPC-201ENST00000318561 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.07■■□□□ 1.12
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SFTPC-201ENST00000318561 RGS19P49795 217 aa22.07■■□□□ 1.12
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SFTPC-201ENST00000318561 CHL1O00533 1208 aa22.06■■□□□ 1.12
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SFTPC-201ENST00000318561 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.05■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 NGEFQ8N5V2 710 aa22.05■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 CFAP44Q96MT7 982 aa22.05■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 WWC1Q8IX03 1113 aa22.04■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 IFT57Q9NWB7 429 aa22.04■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 GNAI1P63096 354 aa22.03■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.03■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.02■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF853P0CG23 659 aa22.02■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 TM4SF1P30408 202 aa22.02■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 USP16Q9Y5T5 823 aa22.02■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.02■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 PASKQ96RG2 1323 aa22.02■■□□□ 1.12
SFTPC-201ENST00000318561 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SFTPC-201ENST00000318561 CANXP27824 592 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SFTPC-201ENST00000318561 TTLL6Q8N841 843 aa22■■□□□ 1.11
SFTPC-201ENST00000318561 MBIPQ9NS73 344 aa22■■□□□ 1.11
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SFTPC-201ENST00000318561 IL16Q14005 1332 aa21.99■■□□□ 1.11
SFTPC-201ENST00000318561 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.98■■□□□ 1.11
SFTPC-201ENST00000318561 ERFEQ4G0M1 354 aa21.97■■□□□ 1.11
SFTPC-201ENST00000318561 WDR63Q8IWG1 891 aa21.97■■□□□ 1.11
SFTPC-201ENST00000318561 COL15A1P39059 1388 aa21.97■■□□□ 1.11
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SFTPC-201ENST00000318561 ZPR1O75312 459 aa21.92■■□□□ 1.1
SFTPC-201ENST00000318561 HOXB7P09629 217 aa21.92■■□□□ 1.1
SFTPC-201ENST00000318561 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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SFTPC-201ENST00000318561 ZNF521Q96K83 1311 aa21.91■■□□□ 1.1
SFTPC-201ENST00000318561 RASSF10A6NK89 507 aa21.91■■□□□ 1.1
SFTPC-201ENST00000318561 NBPF26B4DH59 902 aa21.91■■□□□ 1.1
SFTPC-201ENST00000318561 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.91■■□□□ 1.1
SFTPC-201ENST00000318561 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.91■■□□□ 1.1
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SFTPC-201ENST00000318561 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
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SFTPC-201ENST00000318561 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.88■■□□□ 1.09
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SFTPC-201ENST00000318561 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.87■■□□□ 1.09
SFTPC-201ENST00000318561 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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SFTPC-201ENST00000318561 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.87■■□□□ 1.09
SFTPC-201ENST00000318561 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.87■■□□□ 1.09
SFTPC-201ENST00000318561 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SFTPC-201ENST00000318561 MYL6BP14649 208 aa21.86■■□□□ 1.09
SFTPC-201ENST00000318561 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SFTPC-201ENST00000318561 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SFTPC-201ENST00000318561 GOLGA2Q08379 1002 aa21.85■■□□□ 1.09
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