RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 RUFY3Q7L099 469 aa10.19□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 KIAA1524Q8TCG1 905 aa10.19□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 PI4K2BQ8TCG2 481 aa10.19□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 KCNF1Q9H3M0 494 aa10.19□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 AK2P54819 239 aa10.19□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 FGD1P98174 961 aa10.19□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 RASEFQ8IZ41 740 aa10.19□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 SSH3Q8TE77 659 aa10.19□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 KIF3AQ9Y496 699 aa10.19□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 PSME1Q06323 249 aa10.18□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 STK31Q9BXU1 1019 aa10.18□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 USP44Q9H0E7 712 aa10.18□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.18□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 ZBTB7CA1YPR0 619 aa10.18□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.18□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa10.18□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 POLA2Q14181 598 aa10.17□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa10.17□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 FIBPO43427 364 aa10.17□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 LARGE1O95461 756 aa10.17□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC30Q5VVM6 783 aa10.17□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 GIMAP6Q6P9H5 292 aa10.17□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.17□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 ABTB2Q8N961 1025 aa10.17□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 PYCARDQ9ULZ3 195 aa10.17□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa10.17□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 IGSF1Q8N6C5 1336 aa10.16□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP2B3Q16720 1220 aa10.16□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 HYPKQ9NX55 129 aa10.16□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 MTMR6Q9Y217 621 aa10.16□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 MAP3K5Q99683 1374 aa10.16□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 RAB11FIP3O75154 756 aa10.16□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 TPM3P06753 285 aa10.16□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 NLRP6P59044 892 aa10.16□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 ANKRD7Q92527 254 aa10.16□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 SMC3Q9UQE7 1217 aa10.16□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 USP54Q70EL1 1684 aa10.16□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 SBNO1A3KN83 1393 aa10.16□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 FLT4P35916 1363 aa10.16□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM177BA6PVY3 158 aa10.15□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 CTIFO43310 598 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 ST3GAL1Q11201 340 aa10.15□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 NUTM2GQ5VZR2 741 aa10.15□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 RHPN1Q8TCX5 695 aa10.15□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
UBQLN3-201ENST00000311659 SOX12O15370 315 aa10.15□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 PDE4CQ08493 712 aa10.15□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.15□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 GJB2P29033 226 aa10.14□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 KCNB2Q92953 911 aa10.14□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa10.14□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 KDM3BQ7LBC6 1761 aa10.14□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 CPA1P15085 419 aa10.14□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 VPS53Q5VIR6 699 aa10.14□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 KRT28Q7Z3Y7 464 aa10.14□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa10.14□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 CNTROBQ8N137 903 aa10.14□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 SLAIN2Q9P270 581 aa10.14□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 LTBP4Q8N2S1 1624 aa10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 SURF6O75683 361 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 CASTP20810 708 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 CBX1P83916 185 aa10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 KIF1BPQ96EK5 621 aa10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 EYA1Q99502 592 aa10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC192P0DO97 292 aa10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 ADCK5Q3MIX3 580 aa10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC83Q8IWF9 413 aa10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 TM6SF1Q9BZW5 370 aa10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 SPG7Q9UQ90 795 aa10.13□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 ELP1O95163 1332 aa10.12□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 NPHP3Q7Z494 1330 aa10.12□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.12□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 BRINP3Q76B58 766 aa10.12□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 TTC6Q86TZ1 520 aa10.12□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 PDCL2Q8N4E4 241 aa10.12□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM200AQ8TCP9 573 aa10.12□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 NECTIN2Q92692 538 aa10.12□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 TTC41PQ6P2S7 1318 aa10.12□□□□□ -0.79
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC171Q6TFL3 1326 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms