RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 ATF3P18847 181 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 DCCP43146 1447 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 MBD3O95983 291 aa23.64■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 PDIA6Q15084 440 aa23.64■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 EVI5LQ96CN4 794 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 RGPD5Q99666 1765 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 PHKG2P15735 406 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 HIP1O00291 1037 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC173Q0VFZ6 552 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 SUCLG2Q96I99 432 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 CLCN1P35523 988 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 AACSQ86V21 672 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 TTC14Q96N46 770 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 GPT2Q8TD30 523 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 KAZALD1Q96I82 304 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 DCAF5Q96JK2 942 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.58■■□□□ 1.37
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV5-2P06315 115 aa23.57■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.57■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.57■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.57■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 SLC39A6Q13433 755 aa23.57■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 KCNB2Q92953 911 aa23.57■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 MRC1P22897 1456 aa23.57■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 SASH1O94885 1247 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 GCKRQ14397 625 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 RASEFQ8IZ41 740 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 COL18A1P39060 1754 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM94Q12767 1356 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 MEGF6O75095 1541 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 ESPNB1AK53 854 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 C5P01031 1676 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 AK2P54819 239 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 COPS6Q7L5N1 327 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 VPS53Q5VIR6 699 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 SNRKQ9NRH2 765 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 MYL6BP14649 208 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 COL15A1P39059 1388 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 MYD88Q99836 296 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-201ENST00000311008 RUFY3Q7L099 469 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 CPDO75976 1380 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 PTH1RQ03431 593 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 NECTIN1Q15223 517 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 COPRSQ9NQ92 184 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.49■■□□□ 1.35
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