RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297623.6

C9orf24-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 24, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf24, Length 1,151 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf24-201ENST00000297623 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
C9orf24-201ENST00000297623 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
C9orf24-201ENST00000297623 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
C9orf24-201ENST00000297623 TTLL7Q6ZT98 887 aa19.1■□□□□ 0.65
C9orf24-201ENST00000297623 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
C9orf24-201ENST00000297623 ZBTB7AO95365 584 aa19.09■□□□□ 0.65
C9orf24-201ENST00000297623 POLD1P28340 1107 aa19.09■□□□□ 0.65
C9orf24-201ENST00000297623 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa19.09■□□□□ 0.65
C9orf24-201ENST00000297623 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa19.09■□□□□ 0.65
C9orf24-201ENST00000297623 PLBD2Q8NHP8 589 aa19.09■□□□□ 0.65
C9orf24-201ENST00000297623 SPON1Q9HCB6 807 aa19.09■□□□□ 0.65
C9orf24-201ENST00000297623 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.09■□□□□ 0.65
C9orf24-201ENST00000297623 FLIIQ13045 1269 aa19.08■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 SSH1Q8WYL5 1049 aa19.08■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 ZBTB3Q9H5J0 574 aa19.08■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 NUP98P52948 1817 aa19.08■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 COL24A1Q17RW2 1714 aa19.08■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.07■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 FKBP8Q14318 412 aa19.06■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 KSR2Q6VAB6 950 aa19.06■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 BCL2L12Q9HB09 334 aa19.06■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 ATP10DQ9P241 1426 aa19.06■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 PTPRCP08575 1304 aa19.05■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 KIF16BQ96L93 1317 aa19.05■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 MSL1Q68DK7 614 aa19.05■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 SETDB2Q96T68 719 aa19.05■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 G2E3Q7L622 706 aa19.04■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.04■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 PARP3Q9Y6F1 533 aa19.04■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 CARMIL3Q8ND23 1372 aa19.04■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa19.04■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 PI4KAP2A4QPH2 592 aa19.03■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 MMP10P09238 476 aa19.03■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 NFIXQ14938 502 aa19.03■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 HLFQ16534 295 aa19.03■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.03■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP19.03■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa19.03■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 TM4SF1P30408 202 aa19.02■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 NEXNQ0ZGT2 675 aa19.02■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 TCIRG1Q13488 830 aa19.02■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 PARP10Q53GL7 1025 aa19.02■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 TBC1D9BQ66K14 1250 aa19.02■□□□□ 0.64
C9orf24-201ENST00000297623 DNAAF4Q8WXU2 420 aa19.01■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 SGIP1Q9BQI5 828 aa19.01■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa19.01■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 LRP5O75197 1615 aa19■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 PTGER2P43116 358 aa19■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 BICDL1Q6ZP65 573 aa19■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 ZNF34Q8IZ26 560 aa19■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 ARHGAP45Q92619 1136 aa19■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 RCAN3Q9UKA8 241 aa19■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 ADCY9O60503 1353 aa19■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 NYXQ9GZU5 481 aa18.99■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 NPHP1O15259 732 aa18.98■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 GPTP24298 496 aa18.98■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 DDR1Q08345 913 aa18.98■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.98■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.98■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.98■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 SERPINB2P05120 415 aa18.97■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 MYD88Q99836 296 aa18.97■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 ISCA1Q9BUE6 129 aa18.97■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 BCAR3O75815 825 aa18.96■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 CNBD1Q8NA66 436 aa18.96■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 CCDC191Q8NCU4 936 aa18.96■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 LINS1Q8NG48 757 aa18.96■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 NRXN2Q9P2S2 1712 aa18.96■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.96■□□□□ 0.63
C9orf24-201ENST00000297623 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
C9orf24-201ENST00000297623 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.95■□□□□ 0.62
C9orf24-201ENST00000297623 NLRP10Q86W26 655 aa18.95■□□□□ 0.62
C9orf24-201ENST00000297623 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
C9orf24-201ENST00000297623 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
C9orf24-201ENST00000297623 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.95■□□□□ 0.62
C9orf24-201ENST00000297623 F6X3S4 739 aa18.94■□□□□ 0.62
C9orf24-201ENST00000297623 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa18.94■□□□□ 0.62
C9orf24-201ENST00000297623 ST5P78524 1137 aa18.94■□□□□ 0.62
C9orf24-201ENST00000297623 SLC4A10Q6U841 1118 aa18.94■□□□□ 0.62
C9orf24-201ENST00000297623 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.94■□□□□ 0.62
C9orf24-201ENST00000297623 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
C9orf24-201ENST00000297623 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
C9orf24-201ENST00000297623 ALDH1L1O75891 902 aa18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms