RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 STYK1Q6J9G0 422 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 CNBD1Q8NA66 436 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 MASTLQ96GX5 879 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 SETDB2Q96T68 719 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC93Q567U6 631 aa10.71□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR3GLQ9BT43 218 aa10.71□□□□□ -0.69
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PGGT1B-201ENST00000296642 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PGGT1B-201ENST00000296642 EPHX2P34913 555 aa10.7□□□□□ -0.7
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PGGT1B-201ENST00000296642 PRR5LQ6MZQ0 368 aa10.69□□□□□ -0.7
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PGGT1B-201ENST00000296642 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
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PGGT1B-201ENST00000296642 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-201ENST00000296642 TEFQ10587 303 aa10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC39A6Q13433 755 aa10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D9BQ66K14 1250 aa10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-201ENST00000296642 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-201ENST00000296642 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-201ENST00000296642 NPR1P16066 1061 aa10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-201ENST00000296642 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
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PGGT1B-201ENST00000296642 TPTE2Q6XPS3 522 aa10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
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PGGT1B-201ENST00000296642 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-201ENST00000296642 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
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PGGT1B-201ENST00000296642 IARSP41252 1262 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 GRM1Q13255 1194 aa10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC4GQ6UXB4 293 aa10.64□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 FMNL2Q96PY5 1086 aa10.64□□□□□ -0.71
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PGGT1B-201ENST00000296642 RNF123Q5XPI4 1314 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 IL13P35225 146 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC24Q8N4L8 307 aa10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.63□□□□□ -0.71
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PGGT1B-201ENST00000296642 PANK3Q9H999 370 aa10.62□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF541Q9H0D2 1346 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 SLX4Q8IY92 1834 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNE4Q8N205 404 aa10.61□□□□□ -0.71
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PGGT1B-201ENST00000296642 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 GNAT3A8MTJ3 354 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 CAMTA2O94983 1202 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP4F22Q6NT55 531 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 C7orf43Q8WVR3 580 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 HHIPL1Q96JK4 782 aa10.6□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.6□□□□□ -0.71
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