RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.03■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.02■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.02■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 GLTPD2A6NH11 291 aa26.01■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 FSTL1Q12841 308 aa26.01■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 CNKSR1Q969H4 720 aa26■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHF1Q96S99 279 aa26■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 SRGNP10124 158 aa25.99■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 STYK1Q6J9G0 422 aa25.99■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.98■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.98■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 WDR90Q96KV7 1748 aa25.98■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 MASTLQ96GX5 879 aa25.98■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 NFE2L2Q16236 605 aa25.97■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.97■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 CACNA1SQ13698 1873 aa25.97■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 SLX4Q8IY92 1834 aa25.97■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.97■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 RGL2O15211 777 aa25.96■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CXCL3-201ENST00000296026 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.95■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.94■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.94■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 ERFEQ4G0M1 354 aa25.94■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.94■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.94■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.94■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 FAM177BA6PVY3 158 aa25.93■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 HLFQ16534 295 aa25.93■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.93■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 HTRA3P83110 453 aa25.92■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 SOGA3Q5TF21 947 aa25.92■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 NGEFQ8N5V2 710 aa25.92■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 NPR1P16066 1061 aa25.91■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CXCL3-201ENST00000296026 POTECB2RU33 542 aa25.88■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 IFFO2Q5TF58 517 aa25.88■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.88■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.87■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 RALBP1Q15311 655 aa25.87■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 MYL6BP14649 208 aa25.86■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC93Q567U6 631 aa25.86■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 KLRG1Q96E93 195 aa25.86■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.86■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.85■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.85■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 NUP98P52948 1817 aa25.85■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 RIPK4P57078 832 aa25.84■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 NYXQ9GZU5 481 aa25.83■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.83■■□□□ 1.73
CXCL3-201ENST00000296026 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 ALDH1B1P30837 517 aa25.82■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.82■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.82■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 OLFM4Q6UX06 510 aa25.81■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 ERBB4Q15303 1308 aa25.81■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 ABCC12Q96J65 1359 aa25.81■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 GPTP24298 496 aa25.8■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.79■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.79■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 CRY2Q49AN0 593 aa25.78■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 JMYQ8N9B5 988 aa25.78■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.77■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 SUSD4Q5VX71 490 aa25.77■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.77■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CXCL3-201ENST00000296026 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.76■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.74■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 PDIA6Q15084 440 aa25.74■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 CHADLQ6NUI6 762 aa25.74■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.74■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.74■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 SYNE4Q8N205 404 aa25.74■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.73■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 NTSR2O95665 410 aa25.73■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 POTEIP0CG38 1075 aa25.73■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 POTEJP0CG39 1038 aa25.73■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 NEUROD2Q15784 382 aa25.73■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.72■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 ANXA1P04083 346 aa25.72■■□□□ 1.71
CXCL3-201ENST00000296026 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
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