RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292393.9

ZNF3-201, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF3, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-201ENST00000292393 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF3-201ENST00000292393 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF3-201ENST00000292393 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF3-201ENST00000292393 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.28■□□□□ 0.04
ZNF3-201ENST00000292393 RGL2O15211 777 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF3-201ENST00000292393 GNAI3P08754 354 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF3-201ENST00000292393 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.27■□□□□ 0.04
ZNF3-201ENST00000292393 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.26■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.26■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.26■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.26■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.25■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 A0A087WZG4 1122 aa15.25■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa15.25■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 UTYO14607 1347 aa15.24■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 RPS6KA4O75676 772 aa15.24■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 IGKV5-2P06315 115 aa15.24■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.24■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.24■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 MEIS3Q99687 375 aa15.24■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 USP44Q9H0E7 712 aa15.24■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.24■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 COL15A1P39059 1388 aa15.24■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 C4BP0C0L5 1744 aa15.23■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.23■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 NEURL1BA8MQ27 555 aa15.23■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 MYD88Q99836 296 aa15.23■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.23■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 APBA3O96018 575 aa15.22■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 GNAI2P04899 355 aa15.22■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 TXNRD1Q16881 649 aa15.22■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.22■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.22■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.21■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 ADRA2BP18089 450 aa15.21■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 TCIRG1Q13488 830 aa15.21■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 GCKRQ14397 625 aa15.21■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.21■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.21■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
ZNF3-201ENST00000292393 GRM8O00222 908 aa15.2■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 KCNQ4P56696 695 aa15.2■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.2■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 PROM2Q8N271 834 aa15.2■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 GNPATO15228 680 aa15.19■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 CAMTA2O94983 1202 aa15.19■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 ANKRD44Q8N8A2 993 aa15.19■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 AK7Q96M32 723 aa15.19■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.19■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 EP400Q96L91 3159 aa15.18■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 CEP85Q6P2H3 762 aa15.18■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.18■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 SCN7AQ01118 1682 aa15.18■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 BCORQ6W2J9 1755 aa15.18■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 SSFA2P28290 1259 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 HLFQ16534 295 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 CCDC125Q86Z20 511 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 C1orf115Q9H7X2 142 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 NARFQ9UHQ1 456 aa15.17■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa15.16■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 H7C1W4 665 aa15.16■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 HMMRO75330 724 aa15.16■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 IGHDP01880 384 aa15.16■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 MTX1Q13505 466 aa15.16■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 PARP10Q53GL7 1025 aa15.16■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 TRAPPC3LQ5T215 181 aa15.16■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 SIRT2Q8IXJ6 389 aa15.16■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 ARXQ96QS3 562 aa15.16■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.16■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 CASP7P55210 303 aa15.15■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 ATP8B2P98198 1209 aa15.15■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 NLRP10Q86W26 655 aa15.15■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 CAMKK2Q96RR4 588 aa15.15■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ZNF3-201ENST00000292393 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
ZNF3-201ENST00000292393 BAG6P46379 1132 aa15.14■□□□□ 0.01
ZNF3-201ENST00000292393 SMC5Q8IY18 1101 aa15.14■□□□□ 0.01
ZNF3-201ENST00000292393 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
ZNF3-201ENST00000292393 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
ZNF3-201ENST00000292393 AKT1S1Q96B36 256 aa15.14■□□□□ 0.01
ZNF3-201ENST00000292393 GCC1Q96CN9 775 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms