RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRR-201ENST00000283228 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRR-201ENST00000283228 PPFIA3O75145 1194 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRR-201ENST00000283228 NR1I2O75469 434 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRR-201ENST00000283228 OAS2P29728 719 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRR-201ENST00000283228 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRR-201ENST00000283228 RTL1A6NKG5 1358 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRR-201ENST00000283228 RNF20Q5VTR2 975 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRR-201ENST00000283228 SMARCE1Q969G3 411 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRR-201ENST00000283228 AK7Q96M32 723 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRR-201ENST00000283228 CABP1Q9NZU7 370 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRR-201ENST00000283228 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRR-201ENST00000283228 IQGAP1P46940 1657 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 CEP152O94986 1710 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 MYO1CO00159 1063 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 DDX11Q96FC9 970 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1W2PP64 1363 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD65E5RJM6 399 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 SHPRHQ149N8 1683 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 CLTCL1P53675 1640 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 TULP2O00295 520 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 HSPA4P34932 840 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 TMC6Q7Z403 805 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 LEKR1Q6ZMV7 388 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 G2E3Q7L622 706 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 STK31Q9BXU1 1019 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 PTCH1Q13635 1447 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 MED14O60244 1454 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 PLA2G4DQ86XP0 818 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 LCMT1Q9UIC8 334 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 AOPEPQ8N6M6 819 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 RGS22Q8NE09 1264 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 CARD6Q9BX69 1037 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP13.37□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 NEMFO60524 1076 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 PLA2G4AP47712 749 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 SLC20A2Q08357 652 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 SDF4Q9BRK5 362 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 RAB11FIP3O75154 756 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 CNTROBQ8N137 903 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 FHOD1Q9Y613 1164 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 NSD2O96028 1365 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 KINO60870 393 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 KIF1BPQ96EK5 621 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 CLSTN2Q9H4D0 955 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 POLKQ9UBT6 870 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 CASQ1P31415 396 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 ADCK5Q3MIX3 580 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 BIN1O00499 593 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 PLPPR3Q6T4P5 718 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 PDCP20941 246 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 MCM6Q14566 821 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 ME3Q16798 604 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 PRAM1Q96QH2 718 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 EVCP57679 992 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 ISM2Q6H9L7 571 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 NPHP3Q7Z494 1330 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 SART3Q15020 963 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 E2F4Q16254 413 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 SULT6B1Q6IMI4 303 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 TSPYL4Q9UJ04 414 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 PIK3R4Q99570 1358 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 TRPM2O94759 1503 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 CREBRFQ8IUR6 639 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 CEP57L1Q8IYX8 460 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 DEF6Q9H4E7 631 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRR-201ENST00000283228 PHACTR2O75167 634 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRR-201ENST00000283228 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
PTPRR-201ENST00000283228 OSBPL3Q9H4L5 887 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRR-201ENST00000283228 EFCC1Q9HA90 598 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRR-201ENST00000283228 VPS18Q9P253 973 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRR-201ENST00000283228 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms