RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267328.4

RAB20-201, Transcript of RAB20, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB20, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20-201ENST00000267328 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 ERVV-1B6SEH8 477 aa30.19■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 ARXQ96QS3 562 aa30.19■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa30.19■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 PTPRCP08575 1304 aa30.19■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 RGL2O15211 777 aa30.18■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 DDX58O95786 925 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa30.18■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 NUP98P52948 1817 aa30.18■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 ZPR1O75312 459 aa30.17■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 PLBD2Q8NHP8 589 aa30.17■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 USPL1Q5W0Q7 1092 aa30.16■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 ZBTB3Q9H5J0 574 aa30.16■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 ADCY9O60503 1353 aa30.15■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 MSH5O43196 834 aa30.15■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 BCL2L12Q9HB09 334 aa30.15■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 GYS1P13807 737 aa30.14■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 KSR2Q6VAB6 950 aa30.14■■■□□ 2.42
RAB20-201ENST00000267328 PI4KAP2A4QPH2 592 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 HLFQ16534 295 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 CLEC4GQ6UXB4 293 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 RIC3Q7Z5B4 369 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 SLC16A10Q8TF71 515 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 ARHGAP45Q92619 1136 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 ZNF652Q9Y2D9 606 aa30.12■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 ATP10DQ9P241 1426 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 DNAAF4Q8WXU2 420 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 COL24A1Q17RW2 1714 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 FKBP8Q14318 412 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
RAB20-201ENST00000267328 F6X3S4 739 aa30.07■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa30.07■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa30.07■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 NLGN1Q8N2Q7 840 aa30.07■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 TCIRG1Q13488 830 aa30.06■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 PXDNLA1KZ92 1463 aa30.06■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 TRIM27P14373 513 aa30.05■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 TBC1D9BQ66K14 1250 aa30.05■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 ZNF34Q8IZ26 560 aa30.04■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 MYD88Q99836 296 aa30.03■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 ISCA1Q9BUE6 129 aa30.03■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 ABCC4O15439 1325 aa30.02■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 MTFR1LQ9H019 292 aa30.02■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 TM4SF1P30408 202 aa30.01■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 NEXNQ0ZGT2 675 aa30.01■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 NFIXQ14938 502 aa30.01■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 MSL1Q68DK7 614 aa30.01■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP30.01■■■□□ 2.4
RAB20-201ENST00000267328 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 TNNQ9UQP3 1299 aa30.01■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 UBN2Q6ZU65 1347 aa30■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 ZBTB7AO95365 584 aa30■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 BEND3Q5T5X7 828 aa30■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.99■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa29.99■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 IGKV5-2P06315 115 aa29.99■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 GPTP24298 496 aa29.99■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.99■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 LINS1Q8NG48 757 aa29.99■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 SETDB2Q96T68 719 aa29.99■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 PLIN1O60240 522 aa29.98■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 PARP10Q53GL7 1025 aa29.98■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 BICDL1Q6ZP65 573 aa29.98■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 CARMIL3Q8ND23 1372 aa29.98■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 NLRP10Q86W26 655 aa29.96■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 CCDC191Q8NCU4 936 aa29.96■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 NRXN2Q9P2S2 1712 aa29.96■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 NEURL1BA8MQ27 555 aa29.96■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 MMP10P09238 476 aa29.96■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 MS4A1P11836 297 aa29.96■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 DDR1Q08345 913 aa29.96■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.96■■■□□ 2.39
RAB20-201ENST00000267328 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
RAB20-201ENST00000267328 CCT4P50991 539 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
RAB20-201ENST00000267328 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
RAB20-201ENST00000267328 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa29.95■■■□□ 2.38
RAB20-201ENST00000267328 ALDH1L1O75891 902 aa29.94■■■□□ 2.38
RAB20-201ENST00000267328 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
RAB20-201ENST00000267328 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
RAB20-201ENST00000267328 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.7 ms