RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.29■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.28■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 PHLPP1O60346 1717 aa26.27■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 FAM53CQ9NYF3 392 aa26.27■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 CHRNA2Q15822 529 aa26.27■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 ERICH4A6NGS2 130 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 ABCC4O15439 1325 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 NBPF4Q96M43 638 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 KIAA0232Q92628 1395 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.25■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 TPM3P06753 285 aa26.24■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 PKP1Q13835 747 aa26.23■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.23■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 MPNDQ8N594 471 aa26.23■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.23■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 ADCY5O95622 1261 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB9Q96C00 473 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 PHF14O94880 888 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 RABEP1Q15276 862 aa26.22■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 IL17REQ8NFR9 667 aa26.21■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 USP25Q9UHP3 1055 aa26.21■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 CYP2C19P33261 490 aa26.2■■□□□ 1.79
PITX1-201ENST00000265340 LRRC37A3O60309 1634 aa26.2■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.2■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 SMTNL1A8MU46 457 aa26.19■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa26.19■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 APPP05067 770 aa26.19■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 NOP2P46087 812 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 CTR9Q6PD62 1173 aa26.19■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 ZDHHC9Q9Y397 364 aa26.19■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 NUCB1Q02818 461 aa26.18■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 MAP3K5Q99683 1374 aa26.18■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 RGS12O14924 1447 aa26.18■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.18■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.18■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 RGPD5Q99666 1765 aa26.16■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 ABCA3Q99758 1704 aa26.16■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 PYCARDQ9ULZ3 195 aa26.16■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 RSPH14Q9UHP6 348 aa26.15■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 TRERF1Q96PN7 1200 aa26.15■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.14■■□□□ 1.78
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.14■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 RASSF4Q9H2L5 321 aa26.14■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 KCNF1Q9H3M0 494 aa26.14■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 REC8O95072 547 aa26.13■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 SLC4A2P04920 1241 aa26.13■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 HSPA1LP34931 641 aa26.13■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 ADAMTS2O95450 1211 aa26.12■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa26.12■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.12■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 KCNG1Q9UIX4 513 aa26.12■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 CPDO75976 1380 aa26.11■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 G2E3Q7L622 706 aa26.11■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.09■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.09■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa26.09■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 KDM4AO75164 1064 aa26.09■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 LGR6Q9HBX8 967 aa26.09■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 ERBB3P21860 1342 aa26.09■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 COL18A1P39060 1754 aa26.09■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 MUM1L1Q5H9M0 696 aa26.08■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PITX1-201ENST00000265340 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.07■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 NCAPGQ9BPX3 1015 aa26.07■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.07■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 KMT5BQ4FZB7 885 aa26.07■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 ICE2Q659A1 982 aa26.07■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 LNPKQ9C0E8 428 aa26.07■■□□□ 1.76
PITX1-201ENST00000265340 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms