RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264828.3

COL5A3-201, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL5A3, Length 6,174 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-201ENST00000264828 PANK2Q9BZ23 570 aa20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 NF2P35240 595 aa20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 GPATCH11Q8N954 259 aa20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 LIG1P18858 919 aa20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 CTAGE5O15320 804 aa20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 NLRP5P59047 1200 aa20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 TNIP1Q15025 636 aa20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 STX1AQ16623 288 aa20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 SCLT1Q96NL6 688 aa20.8■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.79■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC96Q2M329 555 aa20.79■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.79■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 SPECC1Q5M775 1068 aa20.79■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.79■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 FANCAO15360 1455 aa20.78■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 LMAN1P49257 510 aa20.78■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 MICALCLQ6ZW33 695 aa20.78■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.78■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.78■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.78■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.78■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 CEP135Q66GS9 1140 aa20.77■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 STARD3NLO95772 234 aa20.77■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.77■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.77■□□□□ 0.92
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.77■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 STX6O43752 255 aa20.76■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 NME9Q86XW9 330 aa20.76■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.76■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.76■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 GSDMDP57764 484 aa20.76■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.76■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 CEP63Q96MT8 703 aa20.76■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 FAM107BQ9H098 131 aa20.76■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.76■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 NOS1P29475 1434 aa20.75■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC175P0C221 793 aa20.75■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.75■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.75■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 MAP3K12Q12852 859 aa20.75■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 MAP3K1Q13233 1512 aa20.75■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.74■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 HOOK3Q86VS8 718 aa20.74■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.74■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.74■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 STAMBPO95630 424 aa20.74■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 NEMFO60524 1076 aa20.74■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 CTNNA2P26232 953 aa20.74■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.74■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 JADE2Q9NQC1 790 aa20.74■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.73■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.73■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 IQCA1Q86XH1 822 aa20.73■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.73■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.73■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 POTEB2H3BUK9 544 aa20.73■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 ATP2C2O75185 946 aa20.73■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.73■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.73■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 HAND2P61296 217 aa20.73■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 RAB34Q9BZG1 259 aa20.73■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.72■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 TRIM27P14373 513 aa20.72■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.72■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 USP16Q9Y5T5 823 aa20.72■□□□□ 0.91
COL5A3-201ENST00000264828 GOLIM4O00461 696 aa20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms