RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 DCTPP1Q9H773 170 aa11.95□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 GNAI2P04899 355 aa11.94□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.94□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAAF4Q8WXU2 420 aa11.94□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 C1orf115Q9H7X2 142 aa11.94□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 ERBB4Q15303 1308 aa11.93□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 HMMRO75330 724 aa11.93□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC39A6Q13433 755 aa11.93□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 PDIA6Q15084 440 aa11.93□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 C8orf34Q49A92 452 aa11.93□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 BEND3Q5T5X7 828 aa11.93□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.93□□□□□ -0.5
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APOBEC1-201ENST00000229304 ALDH1L1O75891 902 aa11.92□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 KSR2Q6VAB6 950 aa11.92□□□□□ -0.5
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APOBEC1-201ENST00000229304 DDX58O95786 925 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
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APOBEC1-201ENST00000229304 TNS2Q63HR2 1409 aa11.91□□□□□ -0.5
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APOBEC1-201ENST00000229304 PROSER3Q2NL68 480 aa11.9□□□□□ -0.5
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKRD45Q5TZF3 282 aa11.9□□□□□ -0.5
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APOBEC1-201ENST00000229304 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.89□□□□□ -0.51
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APOBEC1-201ENST00000229304 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa11.87□□□□□ -0.51
APOBEC1-201ENST00000229304 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
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APOBEC1-201ENST00000229304 MTX1Q13505 466 aa11.86□□□□□ -0.51
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APOBEC1-201ENST00000229304 EMP3P54852 163 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC1-201ENST00000229304 COPS6Q7L5N1 327 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC1-201ENST00000229304 CERKQ8TCT0 537 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC1-201ENST00000229304 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.85□□□□□ -0.51
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APOBEC1-201ENST00000229304 LRP6O75581 1613 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC1-201ENST00000229304 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC1-201ENST00000229304 PLCH1Q4KWH8 1693 aa11.84□□□□□ -0.51
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APOBEC1-201ENST00000229304 NEXNQ0ZGT2 675 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.84□□□□□ -0.51
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APOBEC1-201ENST00000229304 UNC5CLQ8IV45 518 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC1-201ENST00000229304 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC1-201ENST00000229304 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC1-201ENST00000229304 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa11.83□□□□□ -0.52
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APOBEC1-201ENST00000229304 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC1-201ENST00000229304 NBPF26B4DH59 902 aa11.83□□□□□ -0.52
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APOBEC1-201ENST00000229304 RAB11FIP3O75154 756 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC1-201ENST00000229304 IGKV5-2P06315 115 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC1-201ENST00000229304 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC1-201ENST00000229304 VPS72Q15906 364 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC1-201ENST00000229304 DDB1Q16531 1140 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC1-201ENST00000229304 NBPF14Q5TI25 921 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC1-201ENST00000229304 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC1-201ENST00000229304 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC1-201ENST00000229304 MICALL2Q8IY33 904 aa11.83□□□□□ -0.52
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