RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	ARFIP1	P53367	373 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	FOXO1	Q12778	655 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	C18orf63	Q68DL7	685 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ARSK	Q6UWY0	536 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	NXNL1	Q96CM4	212 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	SNX15	Q9NRS6	342 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC189	A1A4V9	331 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	GLOD5	A6NK44	160 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	UGDH	O60701	494 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	LRAT	O95237	230 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	IGKV3-11	P04433	115 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	FBXO45	P0C2W1	286 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	PIK3R1	P27986	724 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	CASQ1	P31415	396 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	PHB	P35232	272 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	GPX6	P59796	221 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	PPP2R2A	P63151	447 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	CBLB	Q13191	982 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	GTF2H2	Q13888	395 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	SETDB1	Q15047	1291 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	ACAP2	Q15057	778 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	MROH9	Q5TGP6	573 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	PACS2	Q86VP3	889 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	RNF175	Q8N4F7	328 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	DOK4	Q8TEW6	326 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	AHSP	Q9NZD4	102 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599		H0YIV9	168 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	HRK	O00198	91 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	PROM1	O43490	865 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	IL2RA	P01589	272 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC35E2	P0CK97	266 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	NT5E	P21589	574 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	BMP5	P22003	454 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	TYK2	P29597	1187 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	GMPR	P36959	345 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	SERPINB8	P50452	374 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	CCNG1	P51959	295 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	PCDH1	Q08174	1060 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	DLG1	Q12959	904 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	CUL3	Q13618	768 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	E2F2	Q14209	437 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	RPS6KA2	Q15349	733 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	TESK1	Q15569	626 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	RTL6	Q6ICC9	239 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	SERPINI1	Q99574	410 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	VPS11	Q9H270	941 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	IPPK	Q9H8X2	491 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A096LPK6	155 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A0A6YYD5	115 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	AHRR	A9YTQ3	701 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	GUCY1B2	O75343	617 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	EED	O75530	441 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	SNX4	O95219	450 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	CLDN9	O95484	217 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	AIFM1	O95831	613 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	GALNS	P34059	522 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25

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