RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636331.1

LINC00854-216, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene LINC00854, Length 718 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-216	ENST00000636331	RCN2	Q14257	317 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	DCST1	Q5T197	706 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	NUBPL	Q8TB37	319 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	KIAA1191	Q96A73	305 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	SARAF	Q96BY9	339 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	FBXL20	Q96IG2	436 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	FMO2	Q99518	471 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	FAM159B	A6NKW6	160 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	GBA	P04062	536 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	FBXO45	P0C2W1	286 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	COX7A2	P14406	83 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	KLK2	P20151	261 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	SSTR4	P31391	388 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	PHB	P35232	272 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	CASP2	P42575	452 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	PIK3CG	P48736	1102 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	RAB10	P61026	200 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	ATP6V0D1	P61421	351 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	PLIN5	Q00G26	463 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	TBCC	Q15814	346 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	MED27	Q6P2C8	311 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	ISCA2	Q86U28	154 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	MMP21	Q8N119	569 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	CBLC	Q9ULV8	474 aa		13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331		A0A1W2PR48	441 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	PROM1	O43490	865 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	HCN1	O60741	890 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	AIFM1	O95831	613 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	CT62	P0C5K7	136 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	MTHFD2	P13995	350 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	GDF1	P27539	372 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	STX2	P32856	288 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	GP5	P40197	560 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	MAGEA4	P43358	317 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	KIR2DL3	P43628	341 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	RAP1GDS1	P52306	607 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	SLC37A1	P57057	533 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	FBXW4	P57775	412 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	DUSP8	Q13202	625 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	LAPTM5	Q13571	262 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	DESI1	Q6ICB0	168 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	CYS1	Q717R9	158 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	CDC20B	Q86Y33	519 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	PRR22	Q8IZ63	422 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	TEX9	Q8N6V9	391 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINC00854-216	ENST00000636331	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29

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