RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635970.1

CLN8-209, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN8, Length 1,958 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-209ENST00000635970 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 FAHD1Q6P587 224 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 P3H2Q8IVL5 708 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 POC5Q8NA72 575 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 VNN3Q9NY84 501 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 WWOXQ9NZC7 414 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CLN8-209ENST00000635970 CPED1A4D0V7 1026 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 MAN1A2O60476 641 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 IDSP22304 550 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PTPN6P29350 595 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ALDH4A1P30038 563 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ETV6P41212 452 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PREPP48147 710 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 OLR1P78380 273 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 NPRL3Q12980 569 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 GLRX5Q86SX6 157 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ARL14Q8N4G2 192 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 IFI44Q8TCB0 444 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ELMO1Q92556 727 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 EPYCQ99645 322 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 EGFL8Q99944 293 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 REEP1Q9H902 201 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.71□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 SERTM1A2A2V5 107 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 HAT1O14929 419 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CLDN9O95484 217 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ACP1P24666 158 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PDHA2P29803 388 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 KRT20P35900 424 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ITGA1P56199 1179 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 HMGCS1Q01581 520 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 MAPK11Q15759 364 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 METRNLQ641Q3 311 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 NUDT8Q8WV74 236 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 RNF6Q9Y252 685 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 RNF215Q9Y6U7 377 aa14.7□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 QSOX1O00391 747 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 RFXANKO14593 260 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PRMT3O60678 531 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ZNF682O95780 498 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 APOA1P02647 267 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 C9P02748 559 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CCR7P32248 378 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 KDELR2P33947 212 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CLDN6P56747 220 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 IL1RL1Q01638 556 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 VEZF1Q14119 521 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 GTDC1Q4AE62 458 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 STEAP3Q658P3 488 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CBLL1Q75N03 491 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CCDC74AQ96AQ1 378 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 ASPMQ8IZT6 3477 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PPM1DO15297 605 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 KCNJ13O60928 360 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 DLGAP3O95886 979 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CYP4B1P13584 511 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 GPX2P18283 190 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 RPIAP49247 311 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 VMACQ2NL98 169 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 C17orf50Q8WW18 174 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 PIK3R3Q92569 461 aa14.69□□□□□ -0.06
CLN8-209ENST00000635970 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms