RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 CREG1O75629 220 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PGRP06401 933 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CYC1P08574 325 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CD1EP15812 388 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TNNI3P19429 210 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PTGER1P34995 402 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 STT3AP46977 705 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 OR4D2P58180 307 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PLIN5Q00G26 463 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 DUSP2Q05923 314 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 HSPB3Q12988 150 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 BIKQ13323 160 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 IL10RAQ13651 578 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SERTAD2Q14140 314 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 RCAN2Q14206 197 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SSPNQ14714 243 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 MPEG1Q2M385 716 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SFT2D3Q587I9 215 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM205Q6UW68 189 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD46Q86W74 232 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 FUNDC1Q8IVP5 155 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 OR8J2Q8NGG1 315 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 VPS33AQ96AX1 596 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 COQ8BQ96D53 544 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ERP27Q96DN0 273 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF681Q96N22 645 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC37BQ96QE4 947 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 OR52E6Q96RD3 313 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 DPH1Q9BZG8 443 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 SLAMF7Q9NQ25 335 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 TAS2R7Q9NYW3 318 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 DKK4Q9UBT3 224 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 PCSK5Q92824 1860 aa7.96□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PRB8 838 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 CDC14CA4D256 554 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 C17orf105B2RV13 164 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 SOCS6O14544 535 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 SLC22A2O15244 555 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 CFLARO15519 480 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 ATP1B1P05026 303 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 C1QTNF9P0C862 333 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 SLC35E2P0CK97 266 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 CAPN3P20807 821 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 NT5EP21589 574 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 MMP11P24347 488 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 MPIP34949 423 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 GPC1P35052 558 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 PGDP52209 483 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 WNT3P56703 355 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 PHC1P78364 1004 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 MAPRE2Q15555 327 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 LTB4RQ15722 352 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 CEBPEQ15744 281 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 VPS26BQ4G0F5 336 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 SNX32Q86XE0 403 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 RAB43Q86YS6 212 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 TREML1Q86YW5 311 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 FITM2Q8N6M3 262 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 NATD1Q8N6N6 113 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 DOK4Q8TEW6 326 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 RIT1Q92963 219 aa7.96□□□□□ -1.14
SGMS1-211ENST00000626236 SPDL1Q96EA4 605 aa7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms