RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STARD8	Q92502	1023 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	APOL4	Q9BPW4	351 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DIABLO	Q9NR28	239 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RGS18	Q9NS28	235 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IFT52	Q9Y366	437 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525		G3V2T6	193 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525		H7C0S8	307 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FXYD1	O00168	92 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IRAK2	O43187	625 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MBTPS2	O43462	519 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RGS14	O43566	566 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DFNA5	O60443	496 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SUPT3H	O75486	399 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CNMD	O75829	334 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SNAPC5	O75971	98 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDK14	O94921	469 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GABARAP	O95166	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTTG1	O95997	202 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OTC	P00480	354 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IFNA2	P01563	188 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ASGR1	P07306	291 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HMBS	P08397	361 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ODC1	P11926	461 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CKMT2	P17540	419 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GGT1	P19440	569 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HAL	P42357	657 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STC1	P52823	247 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DEFA1	P59665	94 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DEFA3	P59666	94 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LIPE	Q05469	1076 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRAF2	Q12933	501 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MTAP	Q13126	283 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPCS2	Q15005	226 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	XKR7	Q5GH72	579 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPR107	Q5VW38	600 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GLYAT	Q6IB77	296 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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