RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 DOK6Q6PKX4 331 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ENPP7Q6UWV6 458 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SLC35F3Q8IY50 421 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 FBXO39Q8N4B4 442 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ACTRT1Q8TDG2 376 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 OR1E3Q8WZA6 343 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SGCDQ92629 289 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 OR2A14Q96R47 310 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 LRRC61Q9BV99 259 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 LRRC40Q9H9A6 602 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 EPB41L5Q9HCM4 733 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PAK5Q9P286 719 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SPASTQ9UBP0 616 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 MOSPD1Q9UJG1 213 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CREBBPQ92793 2442 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PPE2 198 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PR64 198 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 NVLO15381 856 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 HS6ST1O60243 411 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 NEURL1O76050 574 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TPPPO94811 219 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PLAUP00749 431 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 KRT14P02533 472 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 QDPRP09417 244 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CCKBRP32239 447 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CA5AP35218 305 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 FDFT1P37268 417 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 COILP38432 576 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 GNPDA1P46926 289 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CAPZA2P47755 286 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SRP54P61011 504 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PPARDQ03181 441 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 POU6F1Q14863 301 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TGIF1Q15583 401 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 MANEAQ5SRI9 462 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SYT10Q6XYQ8 523 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CFAP77Q6ZQR2 320 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ARL10Q8N8L6 244 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 Q8NFD4 153 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 OR4K2Q8NGD2 314 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 OR56A4Q8NGH8 313 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 OR52K1Q8NGK4 314 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 OR13C4Q8NGS5 318 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SLC9A6Q92581 669 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 COX14Q96I36 57 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 RITA1Q96K30 269 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 C20orf173Q96LM9 149 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SPATA16Q9BXB7 569 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PLK3Q9H4B4 646 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 IL17CQ9P0M4 197 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CENPEQ02224 2701 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SLC22A23A1A5C7 686 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ADAMDEC1O15204 470 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 LDB2O43679 373 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 MTX2O75431 263 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 APRTP07741 180 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM11P17152 192 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CASQ1P31415 396 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 HMGCLP35914 325 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 SPAM1P38567 509 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 DCDC1P59894 354 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 CHRNA6Q15825 494 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD22Q5VYY1 191 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.29□□□□□ -1.24
ATG4D-210ENST00000588972 VASH2Q86V25 355 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms