RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 H0Y3Z8 333 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 FGF17O60258 216 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CRYGSP22914 178 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 GABRB3P28472 473 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 GDF5P43026 501 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ATP5J2P56134 94 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 TGM3Q08188 693 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 GPS1Q13098 491 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 TAGAPQ8N103 731 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 WNT2BQ93097 391 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 EGFL8Q99944 293 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 RBSNQ9H1K0 784 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 LYRM4Q9HD34 91 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 SPACA6W5XKT8 324 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 GNB5O14775 395 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 WDR47O94967 919 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ACTL6AO96019 429 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CPN2P22792 545 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 GAB1Q13480 694 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 SBSNQ6UWP8 590 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF550Q7Z398 422 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 FBXL20Q96IG2 436 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ART5Q96L15 291 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CAPN14A8MX76 684 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 AHSGP02765 367 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 MLNP12872 115 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CPN1P15169 458 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 GSTM2P28161 218 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 GCKP35557 465 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 KCNC1P48547 511 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 HERVK_113P63132 956 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ERVK-8P63133 956 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 VEZF1Q14119 521 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 RPS6KA2Q15349 733 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 SPPL2AQ8TCT8 520 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 SERPINB12Q96P63 405 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 KCNC2Q96PR1 638 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRIM5Q9C035 493 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 A0A1W2PNV4 684 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDC7O00311 574 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 MSTNO14793 375 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 SH3BGRLO75368 114 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 TNFSF13O75888 250 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 PAX1P15863 534 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CD79BP40259 229 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CASP3P42574 277 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAGEA6P43360 314 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLIN5Q00G26 463 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 NINQ8N4C6 2090 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 C7orf57Q8NEG2 295 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 UCN3Q969E3 161 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 REG4Q9BYZ8 158 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 NT5DC2Q9H857 520 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 SOX30O94993 753 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-211ENST00000575783 CCDC175P0C221 793 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms